Diagnostic significance of urinary long non-coding PCA3 RNA in prostate cancer

Abstract

Prostate cancer antigen 3(PCA3) is a long non-coding RNA, which was found increased expression in CaP patients than healthy individual. In this study, the individual nucleic acid of PCA3 and PSA was recombinant expressed as a reference reagent, and a quantitative RT-PCR with TaqMan assay was developed to examine the copies of PCA3 and PSA gene in urine. The results showed that the area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) was 0.717, 0.444 and 0.916 for the number of PCA3 copy, PSA copy and for the score of PCA3/PSA RNA, respectively. Additionally, the AUROC for serum tPSA was 0.674 with a low specificity of 12.07%. Finally, the algorithm of PCA3 RNA versus PSA RNA was evaluated and corroborated as CaP biomarker by conducting a multicentric clinical trial. This study not only validated the developed technique of qRT-PCR with TaqMan assay for examination of urinary PCA3 and PSA RNA, it also demonstrated that the score of the PCA/PSA RNA was a reliable signature for CaP diagnosis.

Comparative analysis of the PCA3 gene expression in sediments and exosomes isolated from urine

“…Чувствительность и специфичность теста РСА3 варьируют в широких пределах по данным раз-ных авторов -от 60 до 95 % -со средними значения-ми этих показателей около 80 %, по данным метаана-лиза [5][6][7]. На диагностическую точность метода может влиять, во-первых, метод анализа экспрессии генов: в оригинальной тест-системе анализа экспрес-сии РСА3 Progensa (Hologic) используется транскрип-ционноопосредованная амплификация, другие авторы применяют обратную транскрипцию и полимеразную цепную реакцию в режиме реального времени (ПЦР-РВ) [8,9]. Во-вторых, немаловажным фактором явля-ется этап пробоподготовки, т. е. способ получения того биоматериала, из которого непосредственно вы-деляют РНК.…”

“…Набор Progensa предполагает анализ мо-чи без предварительной подготовки, ее забирают в среду, где проводят лизис клеток и сорбцию иссле-дуемых матричных РНК (мРНК) со специфичными олигонуклеотидами, иммобилизованными на магнит-ных шариках [8]. При другом подходе РНК выделяют из осадка мочи после центрифугирования [9], ряд ав-торов перед взятием мочи проводят массаж ПЖ в целях увеличения доли клеток из ПЖ в осадке мочи [10,11].…”

Basic characteristics and features of the molecular genetic test systems designed for non-invasive diagnostics and prognosis of prostate cancer and bladder cancer

“…Рассчитывали показатель ΔСt (PCA3-KLK3), который находился в обратной ОНКОУРОЛОГИЯ 4'2019 ТОМ 15 CANCER UROLOGY 4'2019 VOL. 15 21 Лекции зависимостикэкспрессииРСА3.Затемэтотжеподход был применен при исследовании РНК из осадков постмассажноймочиитакжепоказал,чтогиперэкс-прессияРСА3являетсянезависимымдиагностическим критериемРПЖ [22].Темнеменеерассчитываемый показательΔСtвэтихработахявляетсяотносительной величинойизависитотусловийэксперимента.Похожие алгоритмы были использованы в других НИР зарубежнымиисследователями.Например,достовер-ноеувеличениеэкспрессииРСА3приРПЖотноси-тельноконтрольныхгруппДГПЖимочекаменной болезнибылопоказаноприрасчетепоказателя,рав-ного2 -ΔCt×10 ,гдеΔСt=Сt(PCA3)-Ct(ACTB-референсногогена) [23].Другиеавторывсвоейтест-системетакжеиспользовалиметодобратнойтранскрипции иПЦРвреальномвременисTaqMan-зондаминаген РСА3иконтрольKLK3,новкачествепоказателятеста рассчитывалиотношениекопийPCA3 / KLK3 [24].…”

RNA‐based markers in biopsy cores with atypical small acinar proliferation: Predictive effect of T2E fusion positivity and MMP‐2 upregulation for a subsequent prostate cancer diagnosis

“…Over the last decade, molecular alterations detected in urine, serum, peripheral blood and/or tissue samples of PC patients have been found and suggested for use in determining PC diagnosis and prognosis . mRNA expressions of a specific long noncoding RNA, prostate specific antigen 3 ( PCA 3), and serine 2 ( TMPRSS2 ): erythroblastosis virus E26 oncogene homolog ( ERG ) gene ( TMPRSS2 ‐ ERG , T2E ) fusion, a specific molecular alteration of PC, are recommended for analysis in urine, peripheral blood, and/or tissue samples for diagnosis and/or modulating the timing of a repeat biopsy when PC is suspected . Even though these are the best‐known diagnostic molecular markers of PC, different scenarios concerning cut‐off values may emerge dependent on the patients’ histopathological features including the presence of suspicious lesions such as ASAP or high grade prostatic intraepithelial neoplasia (HGPIN) and clinicopathological characteristics including abnormal DRE and/or elevated PSA levels thought to be pathological .…”

“…[18][19][20][21] mRNA expressions of a specific long noncoding RNA, prostate specific antigen 3 (PCA3), and serine 2 (TMPRSS2): erythroblastosis virus E26 oncogene homolog (ERG) gene (TMPRSS2-ERG, T2E) fusion, a specific molecular alteration of PC, are recommended for analysis in urine, peripheral blood, and/or tissue samples for diagnosis and/or modulating the timing of a repeat biopsy when PC is suspected. 18,[22][23][24][25][26] Even though these are the best-known diagnostic molecular markers of PC, different scenarios concerning cut-off values may emerge dependent on the patients' histopathological features including the presence of suspicious lesions such as ASAP or high grade prostatic intraepithelial neoplasia (HGPIN) and clinicopathological characteristics including abnormal DRE and/or elevated PSA levels thought to be pathological. 27 Thus, more clinical validation for the assessment of PC-related molecular markers is required in patients with similar histo-and clinicopathological features.…”