Discovery of SARS-CoV-2 RNA-dependent-RNA-polymerase (RdRp) Inhibitor from Sambiloto (Andrographis paniculata) Based on Molecular Docking and ADMET Prediction Approach

Ahsana, Dina; Pratama, Rizki Rahmadi; Meily, Alfisyahriatunnida; Andika, Andika

doi:10.7454/psr.v9i2.1236

Cited by 1 publication

(1 citation statement)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Setelah itu, struktur protein dioptimalkan dengan menggunakan PDB Swiss dan mengatur medan gaya menggunakan GROMOS96, lalu disimpan dalam format ".pdb file". Penelitian ini menggunakan 5 senyawa flavonoid yang diambil dari PubChem dan remdesivir digunakan sebagai kontrol positif, pemilihan ini dikarenakan remdesivir bekerja dengan berikatan pada RdRp dan dapat menghambat sintesis RNA virus [23][24][25]. Senyawa tersebut kemudian dilakukan minimisasi energi menggunakan software Avogadro, dengan pengaturan medan gaya yang menggunakan MMFF94 [26,27].…”

Section: Preparasi Protein Dan Liganunclassified

Studi In Silico Senyawa Flavonoid dalam Mengambat RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) sebagai Antivirus COVID-19

Muslikh¹,

Pratama

Ma’arif

et al. 2023

J. Islamic Pharm.

View full text Add to dashboard Cite

Pada akhir tahun 2019, muncul coronavirus disease 2019 (COVID-19) yang disebabkan oleh severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), yang menjadi ancaman serius bagi kesehatan masyarakat global sampai saat ini. Seiring berjalannya waktu, pengembangan drug repurposing telah menjadi metode yang efektif dalam penemuan obat baru. Flavonoid merupakan golongan senyawa yang telah dikenal memiliki aktivitas antivirus. Oleh karena itu, tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi lima senyawa flavonoid (Genistein, Daidzein, Glycitein, Formonoetin, dan Biochanin A) yang sudah dikenal memiliki berbagai manfaat farmakologi dalam menghambat aktivitas RdRp SARS-CoV-2. Untuk melakukan analisis, metode molecular docking digunakan dengan menggunakan software AutoDockTools 1.5.6. Prediksi sifat farmakokinetik dan farmakodinamik dilakukan dengan menggunakan SwissADME, sedangkan untuk mengevaluasi toksisitas, digunakan ProTox II. Hasil molecular docking menunjukkan bahwa kelima senyawa flavonoid memiliki hasil yang lebih baik dibandingkan dengan senyawa kontrol positif remdesivir. Selain itu, hasil prediksi sifat farmakokinetik, farmakodinamik, dan toksisitas menunjukkan bahwa Biochanin A, Glycitein, Genistein, dan Formonoetin memiliki potensi terbaik untuk dikembangkan sebagai obat antivirus COVID-19 dengan kemampuan mengikat reseptor RdRp dengan PDB id. 6M71.

show abstract