Diversity of virulence profiles of Shiga toxin-producing Escherichia coli serotypes in food-producing animals in Brazil

Oliveira, Murilo Gomes; Brito, J. R. F.; Gomes, Tânia Aparecida Tardelli; Guth, Beatriz E. C.; Vieira, Mônica A. M.; Naves, Zita V. Furtado; Vaz, Tânia; Irino, Kinue

doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2008.06.023

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“…In different studies on STECs isolated from sheep and goats, this pathotype mostly do not carry stx2 and eae (28,(35)(36)(37)(38). Oliveira et al (32) reported lacking of eae gene among the STECs from ruminants which is almost in agreement with our observation in goats. Since, there are other virulence genes which have been described in eae-negative STECs, such as saa (STEC-autoagglutinating adhesin) and astA (enteroaggregative heat-stable enterotoxin), we suggest checking these sequences in similar studies, too (39,40).…”

Section: Discussionsupporting

confidence: 91%

“…The broad range of detection of STEC was reported in other investigations in Germany (56.1%), Spain (47.7%), Bangladesh (10.0%), and Nigeria (7.5%) (28)(29)(30)(31). In the current study, the genotypic profile stx1 had the most frequency (12%) followed by stx1/stx2 (4%), eae (2.8%), stx1/eae (0.8%), and stx2 (0.4%) which is comparable with other studies carried out by other researchers; Oliveira et al (32) reported the genetic profiles stx1, stx2, and stx1/stx2, with the prevalence rates of 24.1%, 34.7%, and 41.2%, respectively. These rates were 69.8% (stx1), 0.9% (stx2), and 22.5% (stx1 and stx2) in the study by Cortes et al (29).…”

Section: Discussionsupporting

confidence: 89%

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Distribution Pattern of EcoR Phylogenetic Groups Among Shiga Toxin-Producing and Enteropathogenic Escherichia coli Isolated From Healthy Goats

Jajarmi¹,

Ghanbarpour²,

Sharifi³

et al. 2015

Int J Enteric Pathog

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Background: Escherichia coli can be categorized into four major phylogenetic groups (A, B1, B2, and D) based on presence or absence of three markers including two genes (chuA and yjaA) and an anonymous DNA fragment designated TSPE4.C2. Also, these groups are divided into seven phylogenetic subgroups A 0 , A 1 , B1, B2 2 , B2 3 , D 1 , and D 2 . Objectives: This study aimed to determine the distribution pattern of phylogenetic groups in Shiga Toxin-Producing Escherichia coli (STEC) and Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) isolated from asymptomatic goats in Kerman city, Iran. Materials and Methods: Two hundred and fifty fecal samples were obtained from healthy goats. All isolates were subjected to detection of phylogenetic markers chuA, yjaA and DNA fragment TspE4.C2 and virulence genes stx1, stx2 and eae. Results: In summary, among all isolates phylo-group B1 was the most prevalent (57.6%) and other phylo-groups were A 1 (20.4%), A 0 (18.4%), D 1 (2.8%), and B2 2 (0.8%). There was no isolate in B2 3 and D 2 subgroups. Fifty samples (20%) possessed at least one of the tested virulence genes: stx1 (12%), stx1/stx2 (4%), eae (2.8%), stx1/eae (0.8%), and stx2 (0.4%). Thus, 41 (16.4%) STEC, 7 (2.8%) EPEC, and 2 (0.8%) Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) strains were isolated and allocated into four phylogenetic subgroups A 0 (16%), A 1 (12%), B1 (68%), and D 1 (4%). Conclusions: Based on 250 fecal samples obtained from goats in industrial slaughterhouse of Kerman City, goats may be a potential reservoir of STEC in Kerman and B1 followed by A are the most prevalent phylogenetic groups among STEC and non-STEC isolates in this study.

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Section: Discussionsupporting

confidence: 91%

Section: Discussionsupporting

confidence: 89%

Distribution Pattern of EcoR Phylogenetic Groups Among Shiga Toxin-Producing and Enteropathogenic Escherichia coli Isolated From Healthy Goats

Jajarmi¹,

Ghanbarpour²,

Sharifi³

et al. 2015

Int J Enteric Pathog

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“…The stx genes were found in different streams with high urbanisation and also in preserved forest (García-Aljaro et al, 2005;Higgins et al, 2005;Muniesa et al, 2006). Our results show that EHEC was genotyped as stx1 + /stx2 + at the urban site; however the stx2 gene was less than the detection limit in the rural area of the study, which is relevant and worrisome since the stx2 gene is believed to be commonly associated with more severe illnesses (Oliveira et al, 2008). An interesting observation is that the same pathotypes were also found in regional studies with urban pigeons and isolates from human diarrheic feces, indicating the circulation of the same genes in different samples from the city of Juiz de Fora (Silva et al, 2009;.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 65%

Characterization of the microbial community in a lotic environment to assess the effect of pollution on nitrifying and potentially pathogenic bacteria

et al. 2014

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This study aimed to investigate microbes involved in the nitrogen cycle and potentially pathogenic bacteria from urban and rural sites of the São Pedro stream. Water samples were collected from two sites. A seasonal survey of bacterial abundance was conducted. The dissolved nutrient content was analysed. PCR and FISH analysis were performed to identify and quantify microbes involved in the nitrogen cycle and potentially pathogenic bacteria. The seasonal survey revealed that the bacterial abundance was similar along the year on the rural area but varied on the urban site. Higher concentration of dissolved nutrients in the urban area indicated a eutrophic system. Considering the nitrifying microbes, the genus Nitrobacter was found, especially in the urban area, and may act as the principal bacteria in converting nitrite into nitrate at this site. The molecular markers napA, amoA, and nfrA were more accumulated at the urban site, justifying the higher content of nutrients metabolised by these enzymes. Finally, high intensity of amplicons from Enterococcus, Streptococcus, Bacteroides/Prevotella/Porphyromonas, Salmonella, S. aureus, P. aeruginosa and the diarrheagenic lineages of E. coli were observed at the urban site. These results indicate a change in the structure of the microbial community imposed by anthrophic actions. The incidence of pathogenic bacteria in aquatic environments is of particular importance to public health, emphasising the need for sewage treatment to minimise the environmental impacts associated with urbanisation.Keywords: lotic environment, urbanisation, pollution, nitrifying microbes, pathogenic bacteria.Caracterização da comunidade microbiana em um ambiente lótico para acessar o efeito da poluição em bactérias nitrificantes e potencialmente patogênicas ResumoEste estudo objetivou investigar os micro-organismos envolvidos no ciclo do nitrogênio e bactérias potencialmente patogênicas das áreas urbanas e rurais do Córrego São Pedro. Amostras de água foram coletadas dos dois locais. Um levantamento sazonal da densidade bacteriana foi realizado. O teor de nutriente dissolvido foi avaliado. As técnicas de PCR e FISH foram realizadas para identificar e quantificar os micro-organismos envolvidos no ciclo do nitrogênio e bactérias potencialmente patogênicas. O levantamento sazonal revelou que a abundância bacteriana foi semelhante ao longo do ano na área rural, porém variou na região urbana. Altas concentrações de nutrientes dissolvidos na área urbana indicaram este como um sistema eutrófico. Considerando os micro-organismos nitrificantes, o gênero Nitrobacter foi encontrado, especialmente na região urbana, e pode estar atuando como a principal bactéria convertendo nitrito em nitrato nessa área. Os marcadores moleculares napA, amoA, e nfrA foram mais acumulados na área urbana, justificando o alto teor dos nutrientes metabolizados por essas enzimas. Finalmente, alta intensidade de amplicons para Enterococcus, Streptococcus, Bacteroides/Prevotella/Porphyromonas, Salmonella, S. aureus, P. aerug...

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“…Um outro fator importante a ser discutido é a baixa frequência de isolados de STEC nas amostras de couro e carcaça relatada por este e outros estudos anteriormente citados, que contrasta com o elevado número dessas cepas detectadas em fezes de bovinos hígidos ou com diarréia no Brasil (Cerqueira et al, 1999;Irino et al, 2005;Rigobelo et al, 2006;Aidar-Ugrinovich et al, 2007;Farah et al, 2007;Oliveira et al, 2008). Isso demonstra que o abatedouro emprega medidas preventivas, como as boas práticas de higiene, que estão sendo eficientes nas etapas de abate, principalmente durante a remoção do couro e na evisceração, onde a probabilidade de contaminação é maior, podendo colocar em risco a inocuidade do produto.…”

Section: Reação De Polimerização Em Cadeia (Pcr)unclassified

Ocorrência e caracterização de Escherichia coli produtora de toxina de Shiga na linha de abate de bovinos para exportação e em cortes refrigerados de bovinos e de aves comercializados na região da Grande São Paulo

Alvares¹

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Aos meus pais, Márcia e Roberto, com muito amor, por todo apoio e incentivo, não só na realização deste trabalho, mas em vários momentos da minha vida. Aos meus pais, Roberto e Márcia, que sempre acreditaram em mim. Obrigada pelo amor, carinho, confiança e apoio que sempre me deram.Ao meu irmão Thiago "Cabeça", pela união, ajuda e amizade em todos momentos.Às minhas queridas avós Zelinda, pelo amor e velinhas acendidas e Mafalda, pelo amor e pelas bençãos.Ao meu namorado Luiz por todo amor, incentivo, paciência, dedicação e companherismo sempre que precisei.Às amigas-irmãs Bia, Carol e Jan pela amizade verdadeira, conselhos, ajuda e momentos inesquecíveis. Escherichia coli produtoras de toxina de Shiga (STEC) são patógenos veiculados por alimentos capazes de causar desde diarréia branda até severa e sanguinolenta e evoluir para complicações graves como colite hemorrágica, síndrome hemolítica urêmica e púrpura trombótica trombocitopênica. Esses microrganismos têm sido associados a numerosos surtos e vários casos esporádicos de infecções em todo o mundo devido ao consumo de alimentos contaminados. O sorogrupo O157 desse grupo de microrganismos é considerado o principal devido ao seu envolvimento em surtos de doença por STEC, entretanto, muitos casos vêm ocorrendo em todo o mundo devido a cepas patogênicas de STEC não-O157, como O26, O103, O111 e O145. Os objetivos do presente trabalho foram avaliar a ocorrência de STEC em três pontos da linha de abate de bovinos destinados à exportação e em cortes refrigerados de aves e de bovinos comercializados na região da Grande São Paulo; pesquisar a presença dos fatores de virulência dos isolados através dos genes stx 1 , stx 2 , eaeA e ehxA; identificar isolados de E. coli O157:H7 pela pesquisa dos genes uidA, rfb O157 e flic H7 ; verificar a citotoxicidade em células Vero; pesquisar a atividade enterohemolítica dos isolados; avaliar o perfil de suscetibilidade a antimicrobianos; identificar os sorotipos e avaliar a diversidade genética dos isolados de STEC obtidos. Na linha de abate, 201 animais foram amostrados, obtendo-se 603 amostras que compreenderam 201 amostras provenientes do couro, 201 de carcaça e 201 de meia carcaça. No varejo, foram analisadas 100 amostras de cortes de carne bovina e 100 de cortes de frango. A metodologia utilizada para detecção de E. coli sorogrupo O157 foi a preconizada pela ISO 16654, enquanto para os sorogrupos O26, O103, O111 e O145 foi empregada a metodologia descrita pelo "Surveillance Group for Diseases and Infections of Animals" (NRM 006). Os isolados obtidos foram confirmados como STEC pela técnica de PCR. Dos 201 animais amostrados, dois (1,0%) foram positivos para STEC, obtendo-se sete isolados (três do animal número 399 e quatro do animal 401) do couro. Não houve o isolamento do microrganismo nas amostras de carcaça e meia carcaça. Os sete isolados apresentaram o perfil stx 2 , uidA, eaeA, ehxA, rfb O157 e fliC H7 podendo, assim, ser considerados E. coli enterohemorrágica (EHEC) pertencentes ao sorotipo O157:H7. Na avaliação da ativ...

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Diversity of virulence profiles of Shiga toxin-producing Escherichia coli serotypes in food-producing animals in Brazil

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Distribution Pattern of EcoR Phylogenetic Groups Among Shiga Toxin-Producing and Enteropathogenic Escherichia coli Isolated From Healthy Goats

Distribution Pattern of EcoR Phylogenetic Groups Among Shiga Toxin-Producing and Enteropathogenic Escherichia coli Isolated From Healthy Goats

Characterization of the microbial community in a lotic environment to assess the effect of pollution on nitrifying and potentially pathogenic bacteria

Ocorrência e caracterização de Escherichia coli produtora de toxina de Shiga na linha de abate de bovinos para exportação e em cortes refrigerados de bovinos e de aves comercializados na região da Grande São Paulo

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