. 2009. Association of seed and agronomic traits with isoflavone levels in soybean. Can. J. Plant Sci. 89: 477Á484. Soybean, Glycine max (L.) Merr., seeds contain isoflavones, compounds with potential human health benefits. This study investigated the association of seed and agronomic traits with isoflavone level in a genetically diverse group of soybean genotypes to provide more information for cultivar development. F 4:7 lines derived from several crosses were grown in four locations in 2005 and six locations in 2006 across Ontario and Quebec. Seed protein, oil and isoflavone contents were measured using near-infrared reflectance (NIR) on a plot basis. Seed yield was determined at 13% moisture and days to maturity (R8) were recorded. GGE genotype-bytrait biplots were generated to describe the relationships among all variables. Isoflavone content was not correlated with yield, indicating that potential exists for development of high or low isoflavone cultivars without sacrificing yield. Isoflavone content was negatively correlated with protein content, however high isoflavone lines were identified with moderate protein content. Isoflavone content was correlated with maturity suggesting that delayed planting and/or the use of later maturing varieties could be a successful strategy to increase isoflavone content. The results of this study support the potential for the development of either high or low isoflavone soybean cultivars with acceptable agronomic and seed quality traits.Key words: Soybean, isoflavone, protein, oil, yield, maturity Murphy, S. E., Lee, E. A., Woodrow, L., Seguin, P., Kumar, J., Rajcan, I. et Ablett, G. R. 2009. Relation des caracte`res grainiers et agronomiques avec la concentration d'isoflavones chez le soja. Can. J. Plant Sci. 89: 477Á484. Les graines du soja, Glycine max (L.) Merr., contiennent des isoflavones, compose´susceptible d'avoir des effets be´ne´fiques sur la sante´. L'e´tude examinait les liens qui existent entre la concentration d'isoflavones et les caracte`res grainiers et agronomiques dans un groupe de varie´te´s de soja ge´ne´tiquement varie´, dans le but de fournir plus d'informations en vue de cre´er de nouveaux cultivars. Les ligne´es F 4:7 issues de plusieurs croisements ont e´te´cultive´es a`quatre endroits en Ontario et au Que´bec, en 2005, et a`six, en 2006. La teneur en prote´ines, en huile et en isoflavones des graines a e´te´e´tablie par re´flectance dans le proche infrarouge, dans les parcelles. Le rendement grainier a e´te´mesure´a`13 % de teneur en eau et on a enregistre´le nombre de jours jusqu'a`maturite´(R8). L'analyse GGE par double projection du ge´notype et des caracte`res a permis de de´crire les liens entre les variables. La concentration d'isoflavones n'est pas corre´le´e au rendement, signe qu'on pourrait cre´er des cultivars a`faible ou a`forte concentration d'isoflavones sans que le rendement en souffre. La concentration d'isoflavones pre´sente une corre´lation ne´gative avec la teneur en prote´ines, mais les ligne´es produisant beaucoup d'isoflav...