Este texto objetiva explorar a literatura sobre o movimento da medicina baseada em evidência (MBE), com respeito ao seu desenvolvimento teórico e empírico. Procura-se levantar seus principais problemas epistemológicos e éticos, bem como extrair desses problemas algumas lições para a abordagem das políticas públicas baseadas em evidências (PPBEs). Para responder quais os principais desafios da MBE no que se refere ao bem-estar dos pacientes individuais, precisamos de uma análise abrangente, que enfatize, porém, a filosofia da ciência da MBE – seus pressupostos epistemológicos, as estruturas de suas explicações científicas, o papel dos valores no conhecimento científico, bem como as consequências éticas das decisões clínicas.