Estudo in sílico da atividade biológica por docagem molecular da desloratadina contra esquistossomose

Abstract

Objetivo: Avaliar a atividade bioativa da desloratadina através de estudos in sílico por docagem molecular em organismos do gênero Schistosoma. Metodologia: Para o estudo foram coletadas proteínas em 3D dos alvos cathepsin B1 (2cb1), purine nucleoside phosphorylase (pnp), thioredoxin glutathione reductase (tgr), e uridine phosphorylase (up) no banco de dados Protein Data Bank (PDB). As análises de docagem foram realizadas pelo software Autodock Tools (ADT) versão ADT 1.5.6. Posteriormente o ligante desloratadina foi obtido no banco de dados PubChem em estrutura 2D e desenhado no programa GaussView 5.0 e otimizado pelo software Gaussian 09W em método Hartree-Fock na base Default Spin/3-21G. O restante dos parâmetros foi definido de acordo com o método padrão. Resultados: De todos os alvos analisados, a desloratadina obteve os melhores resultados nos receptores up e 2cb1 com energias de ligação de -8,49 e -8,35 Kcal.mol-1 respectivamente. Conclusão: Esses valores demonstram uma boa afinidade molecular em interação dos organismos com a droga desloratadina, além de terem resultados elevados de constante de inibição, demonstrando atividade bioativa da droga antiesquistossomose. Com os presentes resultados in sílico, a droga se torna uma alternativa em estudos bioativos antiesquistossomose, podendo dar continuidade em ensaios in vitro e ex vivo.

Predição computacional de alvos moleculares de um complexo metálico de rutênio com epiisopiloturina e óxido nítrico

“…A estrutura química do Epiruno 2 foi desenhada utilizando-se o software GaussView 5.01 2 , gerando as matrizes de coordenadas cartesianas correspondentes, para que seja gerado o arquivo de entrada e ser realizado os cálculos quânticos computacionais 13 . Uma vez gerado o arquivo de entrada, os cálculos foram submetidos no software Gaussian 09W 14 , onde os cálculos de otimização da geometria molecular e de frequências vibrações da estrutura foram realizados empregandose o método funcional DFT B3LYP, do conjunto de funções de base 6-311G ++ (d,p), com o intuito de obter a geometria molecular tridimensional que seja mais próximo possível da realidade.…”

Molecular Docking and Evaluation of Antileishmania Activity of a Ruthenium Complex with Epiisopiloturine and Nitric Oxide

“…Thus, computational quantum chemistry presents itself as a promising alternative, using several computational tools that predict molecular properties related to a pharmacological potential. Using the laws of quantum chemistry and various programming techniques that are capable of predicting energy state, molecular structures, vibrational frequencies of atomic and molecular systems and molecular interaction between two molecules devel-oping virtual models saving time and materials that would be wasted on experiments in the field laboratory [9] [10].…”