Resumen: Objetivos: Determinar prevalencias de mala nutrición [sobrepeso u obesidad (Sp+O) y talla baja (TB)] en población mexicana de 6 a 12 años de edad de nivel básico de primaria, y su asociación con características geográficas (ámbito, marginación y región del país), y de la escuela (tipo, turno y grado). Métodos: Con información de 10 528 676 escolares, se estimaron prevalencias (e I.C. 95%), a nivel nacional y por características de interés, y su asociación mediante modelos de regresión logística. Resultados: La prevalencia nacional de Sp+O fue 34.4%, 36.5% en ámbito urbano y 40.2% en escuelas privadas. La prevalencia nacional de TB fue 8.7%; en área rural, 13.7% y 28.8% en escuelas tipo indígenas. El Sp+O y la TB se asociaron significativamente con características geográficas y de escuelas. Conclusiones: Existe una polarización nutricional en el contexto escolar del país. Es importante continuar con sistemas de monitoreo y vigilancia nutricional.