Os agroecossistemas de base agroecológica contribuem com a mitigação dos problemas ambientais, ao mesmo tempo que produzem bens e serviços ecossistêmicos. Objetivou-se investigar a composição florística, riqueza e diversidade de plantas em sistemas agroflorestais (SAF) com cafeeiro canéfora (Coffea sp.), como componente principal, estabelecidos no município de Cacoal, Rondônia. Foram inventariados todos os indivíduos com diâmetro a altura do peito maior ou igual a cinco cm, medidos a 130 cm do solo, em sete SAF. Após a identificação das espécies foram calculados os parâmetros de frequência, densidade, dominância, valor de importância, valor de cobertura, similaridade de Jaccard, diversidade de Shannon-Wierner, equabilidade de Pielou e dominância de Simpson. Para a estrutura vertical, os SAF foram estratificados pelo método de Longhi. Foram inventariados 835 indivíduos, distribuídos em 71 espécies, 5 morfoespécies, 54 gêneros e 27 famílias botânicas. As famílias com maior riqueza de espécies foram: Fabaceae, Annonaceae, Myrtaceae, Anacardiaceae e Bignoniaceae. Os SAF apresentaram em sua composição florística gradiente de espécies, com 49% de nativas, 23% exóticas e 28% não foram confirmadas. Os SAF são pouco semelhantes entre si, com nenhuma espécie comum a todos. O índice de diversidade de Shannon-Wierner, variou de 0,54 a 2,79; equabilidade de Pielou 0,42 a 0,87 e dominância de Simpson 0,27 a 0,92. As espécies mais frequentes foram embaúba (Cecropia engleriana Snethl.) e bandarra (Schizolobium parahyba var. amazonicum (Huber ex Ducke) Barneby), presentes em 86% dos SAF. O valor de importância das espécies que compõem os SAF, mostrou um estoque de indivíduos com potencial madeireiro. Os SAF apresentaram-se multiestratificados, com presença de três estratos para todos os agroecossistemas. Em 43% dos SAF os indivíduos melhor representados estão no estrato dois (E2). Os coeficientes encontrados indicam os SAF com cafeeiro com potencial para a conservação da natureza e da agrobiodiversidade.