2022
DOI: 10.1128/mra.00044-22
|View full text |Cite
|
Sign up to set email alerts
|

Five Draft Genome Sequences of Historical Yersinia pestis Strains of Phylogroups 2.MED4 and 2.MED1 of the Medieval Biovar

Abstract: We announce the genome sequences of five historical highly virulent Yersinia pestis strains of the phylogroups 2.MED4 and 2.MED1 of the medieval biovar. They were the etiological agents of plague outbreaks with high mortality rates in the Northern Caspian Sea region at the end of the 19th century and beginning of the 20th.

Help me understand this report

Search citation statements

Order By: Relevance

Paper Sections

Select...
2
2
1

Citation Types

0
0
0
5

Year Published

2023
2023
2023
2023

Publication Types

Select...
5

Relationship

4
1

Authors

Journals

citations
Cited by 5 publications
(6 citation statements)
references
References 6 publications
0
0
0
5
Order By: Relevance
“…Сравнение 78 генов жизнеобеспечения и вирулентности штаммов Y. pestis филогрупп 2.MED4 и 2.MED1 проводили, выравнивая участки генов на референсную последовательность Y. pestis CO92 (номер доступа в GenBank NC_003143.1) с помощью программы MEGA X, exonerate [10] и алгоритма BLAST. Полногеномные последовательности исследованных геномов были депонированы нами ранее в NCBI GenBank [1,3,4].…”
Section: материалы и методыunclassified
See 4 more Smart Citations
“…Сравнение 78 генов жизнеобеспечения и вирулентности штаммов Y. pestis филогрупп 2.MED4 и 2.MED1 проводили, выравнивая участки генов на референсную последовательность Y. pestis CO92 (номер доступа в GenBank NC_003143.1) с помощью программы MEGA X, exonerate [10] и алгоритма BLAST. Полногеномные последовательности исследованных геномов были депонированы нами ранее в NCBI GenBank [1,3,4].…”
Section: материалы и методыunclassified
“…Нами проведен сравнительный анализ 78 генов вирулентности и «домашнего хозяйства» у штаммов Y. pestis филогруппы 2.MED4 и штаммов других ветвей средневекового биовара, полногеномные последовательности которых были депонированы нами ранее в базе данных NCBI GenBank [1,3,4]. С помощью программ MEGA X, exonerate и алгоритма BLAST были проанализированы гены, кодируемые хромосомой (43 гена) и тремя плазмидами возбудителя чумы: pMT1 (3 гена), pCD1 (29 генов), pPCP1 (3 гена).…”
Section: изучение генетических детерминант вирулентности и «домашнего...unclassified
See 3 more Smart Citations