Genotyping Mycobacterium bovis from cattle in the Central Pampas of Argentina: temporal and regional trends

Abstract

Mycobacterium bovis is the causative agent of bovine tuberculosis (TB), a disease that affects approximately 5% of Argentinean cattle. Among the molecular methods for genotyping, the most convenient are spoligotyping and variable number of tandem repeats (VNTR). A total of 378 samples from bovines with visible lesions consistent with TB were collected at slaughterhouses in three provinces, yielding 265 M. bovis spoligotyped isolates, which were distributed into 35 spoligotypes. In addition, 197 isolates were also typed by the VNTR method and 54 combined VNTR types were detected. There were 24 clusters and 27 orphan types. When both typing methods were combined, 98 spoligotypes and VNTR types were observed with 27 clusters and 71 orphan types. By performing a meta-analysis with previous spoligotyping results, we identified regional and temporal trends in the population structure of M. bovis. For SB0140, the most predominant spoligotype in Argentina, the prevalence percentage remained high during different periods, varying from 25.5-57.8% (1994-2011). By contrast, the second and third most prevalent spoligotypes exhibited important fluctuations. This study shows that there has been an expansion in ancestral lineages as demonstrated by spoligotyping. However, exact tandem repeat typing suggests dynamic changes in the clonal population of this microorganism.

Molecular characterization of Mycobacterium bovis infection in cattle and buffalo in Amazon Region, Brazil

“…This DNA extraction method has been reported by our laboratory and others (Lamine‐Khemiri et al, ; Shimizu et al, ; Yahyaoui‐Azami et al, ; Zumárraga et al, ).…”

“…tory and others(Lamine-Khemiri et al, 2013;Shimizu et al, 2014;Yahyaoui-Azami et al, 2017;Zumárraga et al, 2013).…”

Prevención y diagnóstico veterinario de la tuberculosis bovina. Una revisión de las tendencias globales

“…Más que eso, la espoligotipificación dispone de una base de datos internacional (www.mbovis.org) con más de 11.000 patrones de aislamientos, obtenidos en más de 90 países. Su acceso on line permite de forma global reportar nuevos aislamientos, utilizar nomenclatura estándar y conocer adicionalmente regiones afectadas, especie, fin zootécnico, cepas circulantes con patrones genéticos comunes y asociaciones de aislamientos entre animales y humanos [74][75][76][77].…”

“…En Brasil, por ejemplo, los espoligotipos SB0295, SB121, SB1055, SB1145 y SB140 reportados en los estados de Bahía, São Paulo y Minas Gerais, están presentes también en países como Argentina, México, Inglaterra, España, Portugal y Francia [76]. Estudios similares realizados en Colombia evidenciaron, por su parte, la circulación de los genotipos, SB1075, SB0822, SB0121, SB0961, SB0295, SB1190 y SB0120 en bovinos y búfalos de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Magdalena, que había sido identificado previamente en Reino Unido, mientras que los SB0822 y SB0121 lo fueron en Holanda, España, Brasil y México [77] y el SB0120 en Francia, desde 1978 [13], y Argentina [74]. Estos resultados son de enorme utilidad epidemiológica, pues demuestran las consecuencias sanitarias de la movilización de animales falsos negativos, además de la amplia y activa distribución de la TBb, tanto en países desarrollados, como en vías de desarrollo.…”

“…Otra estrategia utilizada para establecer vínculos entre variabilidad genética de M. bovis y su dispersión en la población de hospedadores (epidemiología molecular) es la identificación del número variable de repeticiones en tándem [13,74]. Los beneficios de su uso están asociados con la posibilidad de distinguir cepas relacionadas epidemiológicamente, comparar los resultados con otros laboratorios de países con escenarios epidemiológicos diferentes y no requerir grandes cantidades de ADN.…”