Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pemodelan struktur senyawa turunan eugenol menggunakan metode HKSA (Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas) dan untuk mengetahui aktivitas antimikroba senyawa turunan eugenol pada bakteri Streptococcus mutans. Pemodelan struktur molekul telah dilakukan secara komputasi dengan menggunakan software ChemDraw Ultra 12.0. Hasil optimasi menggunakan metode semi empiris AM1 menghasilkan energi total dan panas pembentukan dari masing-masing senyawa turunan eugenol. Perhitungan hubungan antara deskriptor (elektronik, hidrofobik, dan sterik) dengan aktivitas antimikroba dilakukan dengan menggunakan analisis korelasi yang terdapat dalam program IBM SPSS 25. Hasil analisis menunjukkan terdapat adanya hubungan antara deskriptor dengan antivitas antimikroba (Log P) yaitu EHOMO, ELUMO, Gap, MD, Polarizability, PSA, MSA, Idenks Harary, Indeks Randic, Indeks Weiner, qC1, qC2, qC3, qC6, qC7, dan qC8. Penentuan model persamaan HKSA terbaik dilakukan dengan menganalisis regresi linear berganda menggunakan paket program IBM SPSS 25. Hasil analisis yang didapatkan untuk model persamaan HKSA terbaik terdapat pada persamaan model 1 : Log P = 0.149 − (11.299) qC8 -(9.190) qC2 + (0.163) Polarizability -(6.720) ELUMO -(0.783) MD dengan n = 7, R = 0.999, R2 = 0.998, SE = 0.07399.