<i>In silico</i> Molecular Docking Studies of Quercetin Compound against Anti-inflammatory and Anticancer Proteins

Pavlidis, Paul; Devika, R

doi:10.5958/0974-360x.2019.00919.3

Cited by 21 publications

(3 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…This method allows researchers to obtain valuable information about ligands' binding strength and selectivity, which can contribute to the development of and improvement to new therapeutic drugs. The optimal docking pose was determined in this study by considering specific parameters, including the lowest binding free energy and a root mean square deviation of less than 2 [14,15].…”

Section: Molecular Dockingmentioning

confidence: 99%

Antifungal Potential of Secondary Metabolites Derived from Arcangelisia flava (L.) Merr.: An Analysis of In Silico Enzymatic Inhibition and In Vitro Efficacy against Candida Species

Hendra,

Agustha,

Frimayanti

et al. 2024

Molecules

View full text Add to dashboard Cite

Considering the escalating resistance to conventional antifungal medications, it is critical to identify novel compounds that can efficiently counteract this challenge. The purpose of this research was to elucidate the fungicidal properties of secondary metabolites derived from Arcangelisia flava, with a specific focus on their efficacy against Candida species. This study utilized a combination approach comprising laboratory simulations and experiments to discern and evaluate the biologically active constituents present in the dichloromethane extract of A. flava. The in vitro experiments demonstrated that compounds 1 (palmatine) and 2 (fibraurin) exhibited antifungal properties. The compounds exhibited minimum inhibitory concentrations (MICs) ranging from 15.62 to 62.5 µg/mL against Candida sp. Moreover, compound 1 demonstrated a minimum fungicidal concentration (MFC) of 62.5 µg/mL against Candida glabrata and C. krusei. In contrast, compound 2 exhibited an MFC of 125 µg/mL against both Candida species. Based on a molecular docking study, it was shown that compounds 1 and 2 have a binding free energy of −6.6377 and −6.7075 kcal/mol, respectively, which indicates a strong affinity and specificity for fungal enzymatic targets. This study utilized pharmacophore modeling and Density Functional Theory (DFT) simulations to better understand the interaction dynamics and structural properties crucial for antifungal activity. The findings underscore the potential of secondary metabolites derived from A. flava to act as a foundation for creating novel and highly efficient antifungal treatments, specifically targeting fungal diseases resistant to existing treatment methods. Thus, the results regarding these compounds can provide references for the next stage in antifungal drug design. Further investigation is necessary to thoroughly evaluate these natural substances’ clinical feasibility and safety characteristics, which show great potential as antifungal agents.

show abstract

Section: Molecular Dockingmentioning

confidence: 99%

Antifungal Potential of Secondary Metabolites Derived from Arcangelisia flava (L.) Merr.: An Analysis of In Silico Enzymatic Inhibition and In Vitro Efficacy against Candida Species

Hendra,

Agustha,

Frimayanti

et al. 2024

Molecules

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Quercetin from Coriander & Onion, peppers has higher docking score (−12) than even the active ingredients of the commonest herbal drugs Guggul & Shalaki (<10) [58]. Quercetin is also found to be more effective than even aspirin or celecoxib in the inflammation markers cyclooxygenase (COX) that are vital in cancer biology vide studies in Russia [59] and also in India [60]. Hence, the use of these novel molecules in the arthritis context may be found safe, effective and sustainable.…”

Section: Arthritis Drug Designmentioning

confidence: 99%

Polyphenols, Spices and Vegetarian Diet for Immunity and Anti-Inflammatory Drug Design

Ghate¹,

Kulkarni²

2021

Biosynthesis [Working Title]

View full text Add to dashboard Cite

Much lower COVID-19 incidence and mortality in India compared to the Europe and northern America may relate to higher immunity possibly due to the low consumption of fast/packed food, liquour, tobacco, meat, HFSS- high fat, salt, sugar, besides higher exposure and a key blood protein. Indian spice intake is also double the world average and healthy cooking oil use such as Mustard, and may also explain it. Inflammation is the foundation for many ailments and challenges the immunity and vital in non-communicable ailments are at the centre stage in an aeing world. Polypehnols are crucial anti-inflammatory chemicals from spices that can for wellbeing and reduce adverse drug rections. We show this using Arthritis- a chronic auto-immune disorder, with the hlep of pharmacokinetic studies. Molecular Docking study was performed on the key bioactive compounds of important spices regarding COX2 active site (PDB ID 5IKR). Piperine in Black Pepper had most stability (Black Pepper, −9.99 Kcal/mol) followed by ‘Apigenin’ (Coriander, −9.63), and ‘Curcumin’ (Turmeric, −8.66) like quercetin in literature, and higher than the methotrexate (−8.6), the standard drug. Hence, their synergistic combination in fat medium such as clarified butter can lead the future drug design.

show abstract

“…Потен ційні білкимішені протипухлинної та протизапальної дії кверцетину -(SGK1) та (MAPK14). Були дослідже ні білкимішені протизапальної (біл кові молекули MSX2, HOXA10, HOXA5 та MAPK14) та протипухлин ної (білкові молекули SGK1, BAX, ZnF26 та ADM) дії [23]. Також були проведені дослідження лігандів (зокрема й кверцетину) як дуальних COX2 інгібіторів у контексті впливу на протипухлинну терапію [24].…”

unclassified

In silico аналіз молекулярних механізмів фармакологічної дії кверцетину

Бобкова,

Бухтіарова,

Суворова

et al. 2024

Фармакологія та лікарська токсикологія

View full text Add to dashboard Cite

Сьогодні дослідження механізмів біологічної дії флавоноїдів, таких як кверцетин, рутин, гесперитин, лютеолін та інших, їхніх фармакологічних властивостей є актуальними. У реалізації цього напряму важливе місце має in silico молекулярний докінг, який дає можливість теоретичного передбачення механізму та спектра фармакологічної дії як окремої сполуки, так і ряду сполук, визначити мішень-орієнтовані сполуки-хіти, означити пріоритети цільового пошуку мультитаргетних препаратів тощо. Мета дослідження – огляд in silico досліджень з молекулярних механізмів фармакологічної дії кверцетину як потенційного мультитаргетного препарату. В огляді наведено сучасні дані щодо найпоширеніших in silico досліджень кверцетину – його міжмолекулярних комплексів з різними білками-мішенями. Означено терапевтичний потенціал кверце- тину як протитуберкульозного, протималярійного, протизапального, протипухлинного засобу, а також засобу проти ожиріння та для лікування хвороби Альцгеймера порівняно зі стандартними лікарськими засобами. Представлено результати молекулярного докінгу кверцетину та його аналогів як інгібіторів протеїнів BAX, iNOS, SGK-1, ZnF26, ADM (протипухлинна дія), а також протеїнів COX-2, MSX2, HOXA10, HOXA5, MAPK14 (протизапальна дія). Спрямований пошук потенційних інгібіторів COX-2 в ряду похідних кверцетину є новим напрямом у розробці протизапальних речовин, які важливі при запальних процесах нормальних, а також ракових клітин, здатних модулювати відповідь на хіміотерапію. Фермент iNOS став новою мішенню в пошуку інгібіторів серед деяких протипухлинних речовин (зокрема, кверцетину та його похідних) через свою важливість у спричиненні пухлинної хвороби. Так, підвищений рівень експресії iNOS був виявлений у різних злоякісних пухлинах. У результаті докінгу похідних кверцетину (з відомою протипухлинною дією) було виділено три сполуки – хіти, які показали найкращу взаємодію з ензимом iNOS порівняно з кверцетином. Для кверцетину як мультицільового ліганду були визначені потенційні мішені протипухлинної (SGK-1) та протизапальної дії (MAPK14). У цілому отримані результати вказують, що кверцетин може здійснювати протизапальну та протипухлинну дію шляхом впливу на сигнальний шлях NF-kB.

show abstract

In silico Molecular Docking Studies of Quercetin Compound against Anti-inflammatory and Anticancer Proteins

Cited by 21 publications

References 0 publications

Antifungal Potential of Secondary Metabolites Derived from Arcangelisia flava (L.) Merr.: An Analysis of In Silico Enzymatic Inhibition and In Vitro Efficacy against Candida Species

Antifungal Potential of Secondary Metabolites Derived from Arcangelisia flava (L.) Merr.: An Analysis of In Silico Enzymatic Inhibition and In Vitro Efficacy against Candida Species

Polyphenols, Spices and Vegetarian Diet for Immunity and Anti-Inflammatory Drug Design

In silico аналіз молекулярних механізмів фармакологічної дії кверцетину

Contact Info

Product

Resources

About