Identification of drug resistance and genotyping of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis using the TB-TEST

Experience of Using Tb-Test Technology (Biochip-Imb, Russia) Within the Diagnostic Procedure

“…С 2014 г� в клиническую практику Уральского НИИ фтизиопульмонологии (УНИИФ) внедрены алгоритмы исследования диагностического матери-ала, разработанные совместными усилиями клини-ческих и лабораторных специалистов института [3,6]� Опыт применения показал, что алгоритмы -это правила, которые требуют непрерывного анализа и совершенствования, так как появляются новые перспективные технологии и уточняются клини-ческие потребности и возможности использования и интерпретации результатов лабораторных иссле-дований� Лаборатория микробиологии и ПЦР-диагности-ки УНИИФ, являясь центром передового опыта в сети супранациональных лабораторий по диагно-стике туберкулеза Всемирной организации здра-воохранения, располагает всеми диагностически-ми технологиями, рекомендованными в настоящее время российскими нормативными документами, регламентирующими этиологическую диагности-ку туберкулеза� В первоначально разработанный диагностический алгоритм включены все мето-ды, разрешенные к применению в отечественной клинической практике к 2014 г� С 2015 г� на тер-ритории России зарегистрирован новый набор на основе биологических микрочипов «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», Россия), который имеет ряд преимуществ: данный тест позволяет за одно иссле-дование получить большую информацию� В отличие от диагностических наборов предыдущего поколе-ния (ТБ-Биочип-1, ТБ-Биочип-2), схема проведе-ния «ТБ-ТЕСТ» включает одну мультиплексную ПЦР (вместо двух этапов ПЦР и 2 этапов электро-фореза) с последующей гибридизацией ампликонов на биологическом микрочипе� «ТБ-ТЕСТ» содер-жит праймеры для существенно большего числа му-таций, ассоциированных с лекарственной устойчи-востью (ЛУ) микобактерий туберкулеза (МБТ), по сравнению со всеми другими молекулярно-генети-ческими технологиями (119 мутаций в «ТБ-ТЕСТ», 46 -в Hain-test, 16 -в Амплитуб-МЛУ-РВ)� При этом в одном тесте «ТБ-ТЕСТ» содержатся прай-меры для выявления мутаций устойчивости как к первому, так и ко второму ряду противотуберкулез-ных препаратов, а также праймеры, позволяющие провести дифференциацию по принадлежности МБТ к различным генетическим линиям (Beijing, Beijing BO/W148, Haarlem, LAM и Ural) [1,2,4,5,7,9,10,15,18,19]� Таким образом, данная тест-си-стема позволяет получить за один тест такой объем информации, который требует нескольких постано-вок в других тест-системах� Кроме того, «ТБ-ТЕСТ» является полностью отечественной разработкой, следовательно, потребители в меньшей степени зависят от зарубежных поставщиков и колебаний курса валют� Цель исследования: проанализировать резуль-таты включения в диагностический алгоритм туберкулеза легких технологии «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», Россия)� Материалы и методы Проанализированы результаты, полученные в ла-боратории УНИИФ после включения технологии «ТБ-ТЕСТ» («БИОЧИП-ИМБ», Россия) (10 меся-цев 2016/2017 г�) в диагностический алгоритм ис-следования клинического материала, а именно: ка-кие пациенты обследованы, какой диагностический материал, какова бактериальная нагрузка образцов, каковы сроки получения результатов, совпадение данных, полученных молекулярно-генетическими методами (МГМ), с результатами культурального исследования� Помимо включения технологии «ТБ-ТЕСТ», в диагностическом алгоритме еще произвели заме-ну исходного теста определения степени бактери-альной нагрузки образца с микроск...…”