Bacterial identification based on protein mass spectrometry:A new insight at the microbiology of the 21 st centuryBacterial identification is important for the proper treatment of infected patients hospitalized with serious infections especially in critical care units. Identification by conventional methods used in microbiology laboratories takes at least 16 hours since a culture is positive. The introduction of mass spectrometry, specifically MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometer) in the microbiology laboratory could mean a radical change in the identification accuracy, turn around time (6 minutes per bacteria) and cost (about 5 times cheaper than conventional identification). Since its introduction in clinical microbiology laboratories in 2008, many reports about its usefulness in identifying microorganisms from colonies, as well as directly from positive blood cultures and urine samples have been published. This review describes MALDI-TOF MS methodology, its identification performance for bacteria (aerobic and anaerobic), mycobacterium and yeasts, its future applications in microbiology and its main disadvantages.Key words: Bacterial identification, mass spectrometry. Palabras clave: Identificación bacteriana, espectrometría de masas, MALDI-TOF MS.
Pontificia Universidad Católicade Chile, Santiago.
Facultad de MedicinaDepartamento de Laboratorios
Clínicos Laboratorio deMicrobiología (PG).
Servicio de Laboratorios Clínicos (MH).Departamento de Laboratorios Clínicos.
Laboratorio de Bioquímica, SecciónEspectrometría de Masas (FA, SS).
Departamento de MedicinaInterna (PL).
Conflictos de interés: no hay.
Recibido: 19 de julio de 2011Aceptado: 26 de noviembre de 2011
Correspondencia a:Sandra Solari Gajardo, ssolari@med.puc.cl
IntroducciónT radicionalmente la identificación bacteriana se ha basado en la utilización de métodos fenotípicos que incluyen las características morfológicas y tintoriales que presentan los microorganismos en distintos medios de cultivos, así como las reacciones bioquímicas propias de cada especie 1 . Sin embargo, esto conlleva una carga laboral y consumo de tiempo importante para el laboratorio, puesto que la identificación bacteriana puede tomar desde horas e incluso hasta días, sobre todo para aquellos microorganismos fastidiosos, lo cual sin duda, impacta directamente en el pronóstico del enfermo, pues es sabido que mientras más precoz y apropiado es el antimicrobiano, menor es la mortalidad del paciente, en especial para aquellos que están graves [2][3][4] . Es así como algunos reportes demuestran un incremento en la mortalidad de 7% por hora cuando existe un retraso en el inicio de antimicrobianos para aquellas personas que están hipotensas y en estado séptico 5 . Ante esta situación se ha generalizado el uso precoz de antimicrobianos de amplio espectro dado la dificultad para obtener un diagnóstico rápido de las bacterias involucradas, lo que ha llevado al uso, muchas veces, de tratamientos indebidos, con la consiguiente preocupació...