Improving discrimination for malting quality in barley breeding programmes

Gianinetti, Alberto; Toffoli, Fabiano; Cavallero, Andrea; Delogu, Giovanni; Stanca, A. M.

doi:10.1016/j.fcr.2005.01.002

Cited by 18 publications

(21 citation statements)

References 23 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Moreover, they are often influenced by environmental factors and by technological treatment (Fox et al 2003). Discriminant analysis can be a method for selecting the most suitable set of variables for distinguishing between selected features (Gianinetti et al 2005). In our study, discriminant analysis was employed to distinguish between barley genotypes suitable or unsuitable for PGI "České pivo".…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

“…SSR have been used extensively for genome mapping and cultivar identification (Goldstein & Schlötterer 1999;Pillen et al 2000). Gianinetti et al (2005) proposed a system of malting quality evaluation based on only a few traits, depending on environmental conditions as little as possible. This system was intended for breeders for line testing in early generations of the selection process.…”

mentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

The application of microsatellite analysis in barley malting quality breeding programmes

Leišová‐Svobodová

Tomková

Sedláček

et al. 2014

CZECH J GENET PLANT

View full text Add to dashboard Cite

Leišová-Svobodová L., Tomková L., Sedláček T., Psota V., Kučera L. (2014): The application of microsatellite analysis in barley malting quality breeding programmes. Czech J. Genet. Plant Breed., 50: 268-277.A set of 43 microsatellite loci was used to characterise the malting barley varieties and breeding lines used for the Protected Geographical Indication (PGI) "České pivo" ("Czech beer") and for other beer types. Genotype data were compared with technological malting quality parameters. The analysis of variance showed significant differences between varieties used for the given PGI and varieties used for other beer types in six variables. Three clusters of varieties specific to the PGI and three clusters specific to malting barley genotypes for other beer types were identified using a Bayesian approach. The remaining four clusters expressed effects of parent lines. The discrimination analysis based on malting quality and molecular variables identified only one barley breeding line suitable for the PGI "České pivo"".

show abstract

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

mentioning

confidence: 99%

The application of microsatellite analysis in barley malting quality breeding programmes

Leišová‐Svobodová

Tomková

Sedláček

et al. 2014

CZECH J GENET PLANT

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Barley cultivar Scarlett (of high malting quality) was malted as described in Gianinetti et al (2005). Samples of green malt (i.e., unkilned, moist, germinating grains) were collected during malting and stored in 50 mL Falcon tubes under absolute ethanol at -20°C for subsequent staining.…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

A theoretical framework for β-glucan degradation during barley malting

Gianinetti¹

2009

Theory Biosci.

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

During malting, barley germinates and produces hydrolytic enzymes that de-structure the endosperm, making the grains soft and friable. This process starts close to the embryo and spreads throughout the whole grain. It is leaded by the degradation of cell walls, which are mainly constituted of beta-glucans. Fast and extended breakdown of beta-glucans occurs by means of an expanding reaction front driven by beta-glucanase, and appears to follow pseudo-first-order kinetics. Endosperm permeabilization to macromolecules is closely linked to the dismantling of cell walls, thus that access to beta-glucans by beta-glucanase itself is limited. It is shown that the kinetics of beta-glucan degradation during malting are consequent to this condition, and can be explained according to an anomalous evolution of the reverse quasi-steady-state approximation (rQSSA) for enzymatic reactions. In fact, kinetics based on the rQSSA include a transient phase wherein fast substrate depletion is indeed of pseudo-first-order. In the germinating barley, the conditions in which the physical modification of the endosperm occurs are shown to be suitable for the fast transient to persist in dynamic equilibrium while it progressively expands throughout the grain, depleting most beta-glucans and, then, establishing the overall kinetics of beta-glucan breakdown.

show abstract

“…Malting traits, to a certain extent, mutually compensate each other and with the use of advanced statistical methods, these mutual compensation relationships can be identifi ed and processed in mathematical models, which enable a correct classifi cation of the analyzed genotypes (Gianinetti et al, 2005). A similar approach was selected for designing a classifi cation function for the identifi cation of the genotypes with quality suitable for "České pivo".…”

Section: ■ 4 Discussionmentioning

confidence: 99%

“…Sladovnické znaky se do jisté míry navzájem kompenzují a s využitím pokročilých statistických metod je možné jejich vzájemné kompenzační vztahy zachytit a zapracovat do matematických modelů umožňujících správnou klasifi kaci analyzovaných genotypů (Gianinetti et al, 2005). Obdobný přístup byl zvolen pro vypracování klasifi kační funkce pro identifi kaci genotypů s kvalitou vhodnou pro "České pivo".…”

Section: ■ 4 Diskuzeunclassified

Classification of barley varieties for "České pivo" using discriminant analysis

Sedláček¹,

Psota²

2015

Kvasny Prum

View full text Add to dashboard Cite

Klasifi kace odrůd ječmene pro "České pivo" s využitím diskriminační analýzyKlíčová slova: sladovnická kvalita, Chráněné zeměpisné označení "České pivo", diskriminační analýza ■ 1 ÚVOD Chráněné zeměpisné označení "České pivo" (dále jen CHZO "České pivo") bylo zapsáno do Rejstříku chráněných zeměpisných označení v roce 2008 (Commission, 2008. V témže roce doporučil VÚPS první odrůdy splňující kvalitativní požadavky na výrobu piva s CHZO "České pivo" (Psota, 2008). Byly to již dříve registrované odrůdy, které splňovaly v žádosti uvedené požadavky. Odrůdy pro "České pivo" mají mít především nižší úroveň prokvašení a nižší proteolytické rozluštění. To je pro šlechtitele dosti zásadní změna dosavadního pohledu na sladovnickou kvalitu nových odrůd ječmene.Pro úspěšné šlechtění je třeba mít k dispozici dostatečně robustní selekční kritéria. V případě monogenně založených znaků je jejich dědičnost jednoduchá a selekce účinná na základě jasných fenotypových projevů (Baker, 1986). V případě polygenně založených znaků, mezi které kvalita patří, je situace mnohem obtížnější. Pro charakterizaci sladovnické kvality se používá řada parametrů, z nich každý postihuje pouze určitou část komplexní problematiky. Vzhledem k tomu, že i tyto dílčí kvalitativní znaky jsou polygenně založené, je selekce na sladovnickou kvalitu velmi obtížná (Swanston a Ellis, 2002). K polygennímu charakteru a komplexní problematice Klasifi kace odrůd ječmene pro "České pivo" s využitím diskriminační analýzy Classifi cation of barley varieties for "České pivo" using discriminant analysis Získání chráněného zeměpisného označení "České pivo" vedlo k nutnosti cíleného šlechtění odrůd ječmene s vlastnostmi odpovídají-cími parametrům tohoto typu piva. V této studii jsme sledovali vliv odrůd a vliv lokality pěstování na hlavní ukazatele sladovnické jakosti s cílem identifi kovat nejvhodnější selekční kritérium. Jako vhodné parametry se ukázaly relativní extrakt při 45 °C, obsah β-glukanů ve sladině a Kolbachovo číslo. Protože tyto parametry také výrazně ovlivňuje prostředí a reziduální vlivy, vyvinuli jsme klasifi kační funkci s využitím diskriminační analýzy. Funkce úspěšně klasifi kovala 94 % vzorků bez ohledu na lokalitu pěstování, mohla by se tudíž stát vhodným nástrojem pro výběr linií ječmene splňujících kvalitativní požadavky kladené na odrůdy doporučené pro výrobu piva s chráně-ným zeměpisným označením "České pivo". Sedláček, T. -Psota, V.: Classifi cation of barley varieties for "České pivo" using discriminant analysis. Kvasny Prum. 61, 2015, No. 9, pp. 262-267 Awarding of the Protected Geographical Indication "České pivo" (i.e. Czech Beer) led to the necessity of targeted breeding of barley varieties. This study investigated the effect of varieties and growing sites on the key indicators of malting quality with the aim to identify the most suitable selection criteria. Relative extract at 45 °C, β-glucan content in wort, and Kolbach Index were identifi ed as the most suitable parameters. As these parameters are also signifi cantly affected by the ...

show abstract

Improving discrimination for malting quality in barley breeding programmes

Cited by 18 publications

References 23 publications

The application of microsatellite analysis in barley malting quality breeding programmes

The application of microsatellite analysis in barley malting quality breeding programmes

A theoretical framework for β-glucan degradation during barley malting

Classification of barley varieties for "České pivo" using discriminant analysis

Contact Info

Product

Resources

About