Influence of methylation of nucleic acid purine bases on their interactions with amino acids through the carboxylic group

Kolomiets, Iryna M.; Kondratyuk, I. V.; Stepanyugin, A. V.; Samoilenko, S. A.; Zheltovsky, N. V.

doi:10.1016/0022-2860(91)80118-n

Cited by 15 publications

(8 citation statements)

References 2 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…1, 2) нагадує зміни в спектрі його суміші з m 2 2,9 Gua, однак менші за величиною, що можна інтерпретувати як взаємодію m 2 G з карбоксилатіоном за схемою, подібною до утворюваної m 2 2,9 Gua в комплексі з депротонованою карбоксильною гру пою. За даними ЯМР [46][47][48][49], одноразове метилзаміщення аміногрупи як в m 2 2, 9 Gua, так і в m 2 G призводить до значного підсилення взаємодії з карбоксилат-іоном внаслідок підсилення кислот ності позосталого амінопротона.…”

Section: рис 3 уф спектри поглинання в дмсо: а -M Gua (у) його сумunclassified

“…Аналіз даних УФ спектроскопії та результатів дослідження за допомогою 14 спектроскопії і ЯМР [46][47][48][49] дозволяє запропонувати схеми взаємодії А та В форм m 7 G з нейтральною та депротонова ною формами карбоксильної групи відповідно (рис 2, схеми г та д).…”

Section: рис 4 уф спектри поглинання в дмсо: A-m 7 G (у) його суміunclassified

“…5, а), що свідчить про появу здатності утворювати слабкий комплекс з нейт ральною карбоксильною групою. Оскільки фраг мент 0=C6-N1=C2-NH 2 m 3 Gua подібний до фраг мента цитозину 0=C2-N3=C6-NH 2 , логічно запро понувати схему взаємодії з нейтральною карбо ксильною групою (рис 2, схема IV), аналогічну до схеми взаємодії m Cyt з ас-Asp [46][47][48][49], хоча в останньому випадку спектральні прояви комплексоутворення в багато разів більші.…”

Section: рис 4 уф спектри поглинання в дмсо: A-m 7 G (у) його суміunclassified

“…У ДМСО з домішкою води [42][43][44][45] та у воді [45] Gua утворює специфічний комплекс з депро тонованою карбоксильною групою (карбоксилатіоном). Серію робіт [46][47][48][49][50] присвячено дослід женню специфічності взаємодії низки похідних гу аніну з карбоксильною групою амінокислот та карбоксилат-іоном у зневодненому ДМСО.…”

unclassified

See 3 more Smart Citations

Influence of methylation and interactions with amino acid carboxylic group on UV spectra of purine nucleotide bases and nucleosides in dimethylsulfoxide. 2. Guanine

et al. 2000

View full text Add to dashboard Cite

Вплив метилювання та взаємодії з карбоксильною групою амінокислот на УФ спектри пуринових нуклеотидних основ та нуклеозидів у диметилсульфоксиді. 2. Гуанін А. В. Степанюгін, І. М. Коломієць, А-Л. Потягайло, С. П. Самійленко Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, 03143, Україна Вивчено УФ спектри поглинання у зневодненому ДМСО похідних гуаніну m 9 Gua, m2 2,9 Gua, m l Gua, m2 l>1 Gua t G, dG, m l G, m 2 G, m 7 G, а також його аналога isoGua. Досліджено та інтерпретовано зміну УФ поглинання похідних Gua в присутності похідних амінокислот, що містять нейтральну карбоксильну групу ас-Asp, ac-Glu, ac-Gly. ac-Asp-OMe ma f-GlyONa і NaAc з депротонованою карбоксильною групою. Показано, що т Gua та m n Gua у зневодненому ДМСО існують як таутомери N9H. Встановлено, що переважна більшість досліджених похідних Gua взаємодіє лише з депротонованою карбоксильною групою, за винятком m n G, isoGua та m 3 Gua, здатних утворю вати комплекси також із нейтральною карбоксильною групою. Розраховано енергетичні харектеристики прототропних таутомеріє Gua та їхніх комплексів з карбоксилат-іоном напівемпіричним методом MNDO/H у вакуумному наближенні

show abstract

Section: рис 3 уф спектри поглинання в дмсо: а -M Gua (у) його сумunclassified

Section: рис 4 уф спектри поглинання в дмсо: A-m 7 G (у) його суміunclassified

unclassified

See 2 more Smart Citations

Influence of methylation and interactions with amino acid carboxylic group on UV spectra of purine nucleotide bases and nucleosides in dimethylsulfoxide. 2. Guanine

et al. 2000

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…The use of DMSO as a solvent allows us to observe rather strong interactions which exceed its interactions with the bases and amino acid carboxylic groups. The systematic studies of these complexes were conducted by means of UV, IR and NMR spectroscopies over the last few years [23][24][25][26][27][28][29][30][31]. Interpretations of the results were supported by the model semiempirical quantum-mechanical calculations [32].…”

mentioning

confidence: 99%

Model considerations on physico-chemical nature of protein-nucleic acid contacts through amino acid carboxylic groups: spectroscopic data

et al. 1998

View full text Add to dashboard Cite

This paper generalizes the results of a series of the works on spectroscopic (IR, UV, NMR, Raman) investigations of complexes of nucleotide bases, their numerous methyl and glycosyl derivatives with amino acid carboxylic groups modelling point protein-nucleic acid contacts. The specificity of interactions between bases and two forms of carboxylic group-neutral and deprotonated-was determined. The structures of the complexes investigated were established, and the role of various atomic groups in their formation was elucidated as well. Special consideration has been given to the frequent occurrence of proton transfer in the studied complexes. The significance of the data obtained in understanding of elementary mechanisms of protein-nucleic acid interactions is discussed.

show abstract

ChemInform Abstract: Influence of Methylation of Nucleic Acid Purine Bases on Their Interactions with Amino Acids Through the Carboxylic Group.

Kolomiets¹,

Kondratyuk²,

Stepanyugin³

et al. 1992

ChemInform

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Influence of methylation of nucleic acid purine bases on their interactions with amino acids through the carboxylic group

Cited by 15 publications

References 2 publications

Influence of methylation and interactions with amino acid carboxylic group on UV spectra of purine nucleotide bases and nucleosides in dimethylsulfoxide. 2. Guanine

Influence of methylation and interactions with amino acid carboxylic group on UV spectra of purine nucleotide bases and nucleosides in dimethylsulfoxide. 2. Guanine

Model considerations on physico-chemical nature of protein-nucleic acid contacts through amino acid carboxylic groups: spectroscopic data

ChemInform Abstract: Influence of Methylation of Nucleic Acid Purine Bases on Their Interactions with Amino Acids Through the Carboxylic Group.

Contact Info

Product

Resources

About