RESUMO Objetivo: analisar os desafios presentes no trabalho de enfermeiros gestores no contexto hospitalar, no Brasil e em Portugal. Método: pesquisa de métodos mistos, abordagem explanatório sequencial, realizada com enfermeiros gestores de quatro hospitais, entre março de 2019 e março de 2020. O estudo iniciou com a etapa quantitativa, aplicando um survey a 143 participantes e dados analisados por estatística analítica e inferencial. A etapa qualitativa foi realizada com 71 destes participantes utilizando entrevistas, para compreender os desafios deste trabalho, e os dados foram submetidos à análise de conteúdo. A integração dos achados foi realizada por meio de conexão de dados. Resultados: na etapa quantitativa os resultados evidenciaram que as atividades de gestão realizadas pelos enfermeiros por cenário, incluíram planejamento, gestão de pessoas, de processos assistenciais, de materiais, da qualidade e liderança, com maiores médias para os quatro primeiros. A qualitativa permitiu aprofundar os achados anteriores, contrastando a invisibilidade do planejamento, confirmando a gestão de pessoas como o desafio comum às realidades, explicando as médias nas realidades nacional e portuguesa. A integração dos achados detalhou na gestão de pessoas e liderança a relevância dos conflitos e do déficit de profissionais. Conclusão: gerenciar pessoas, processos assistenciais e materiais se mostram desafios dos enfermeiros na gestão hospitalar nos dois países. Os enfermeiros carecem de suporte estrutural e formação continuada para melhor gestão e aprimoramento do planejamento e liderança.