Integrated reverse transcription polymerase chain reaction systems for virus detection☆

Lien, Kang-Yi; Lee, Wan-Chi; Lei, Huan‐Yao; Lee, Gwo‐Bin

doi:10.1016/j.bios.2006.08.010

Cited by 115 publications

(61 citation statements)

References 22 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Comparison of the VP1 sequence with databases of VP1 sequences of HEV prototype and variant strains (18) allows genotype assignation. Other molecular methods that assist in serotype-specific identification include multiplex real-time hybridization probe RT-PCR for specific detection and differentiation of enterovirus type 71 (EV71) and CVA16 (28), combined multiplex RT-PCR and microarray assay to detect and differentiate EV71 and CVA16 (4), molecular characterization of PV strains by RT-PCR-restriction fragment length polymorphisms (2), and an integrated micro-RT-PCR system for automatic detection of microorganisms, including EV71 (11). Experience with microwell oligonucleotide arrays (27) and other non-sequencing-based molecular methods to genotype other HEV serotypes is limited.…”

mentioning

confidence: 99%

Identification of 20 Common Human Enterovirus Serotypes by Use of a Reverse Transcription-PCR-Based Reverse Line Blot Hybridization Assay

et al. 2009

View full text Add to dashboard Cite

mentioning

confidence: 99%

Identification of 20 Common Human Enterovirus Serotypes by Use of a Reverse Transcription-PCR-Based Reverse Line Blot Hybridization Assay

et al. 2009

View full text Add to dashboard Cite

“…Ezt követően különböző reakciókkal a PCR-t kvantitatívvá tették (Q-PCR), amelyek közül a PCR-termékhez specifi kusan kötődő fl uoreszcens próbák (példá-ul TaqMan ® ) alkalmazása terjedt el legnagyobb mérték-ben és ennek lett legnagyobb a diagnosztikai jelentősége is [5]. A real-time PCR és az RT-PCR kombinálásával (Q-RT-PCR) a génexpresszió és a vírusrészecskék kvantifi kálása [6,7] is lehetővé vált.…”

Section: A Pcr-alapú Módszerek Jellemzői éS Alkalmazási Lehetőségei éunclassified

Élelmiszer-biztonsági jelentőségű baktériumok molekuláris detektálásának fejlesztése miniatürizált mikrofluidikai eszközök segítségével

Iván

Maráz

2015

Orvosi Hetilap

View full text Add to dashboard Cite

A biztonságos élelmiszerek előállítása szempontjából kulcsfontosságú az élelmiszerrel terjedő patogén baktériumok kimutatása és azonosítása. A hagyományos, tenyésztésen alapuló diagnosztikai eljárásokat egyre inkább felváltják vagy kiegészítik a nukleinsav-alapú, a genom speciális (elsősorban virulencia) génjeinek kimutatását célzó molekuláris technikák. A rutin élelmiszer-mikrobiológiai vizsgáló laboratóriumok leggyakrabban nemzetközileg validált DNSamplifi kációs, elsősorban valós idejű polimeráz láncreakció alapú módszereket alkalmaznak, amelyek a vizsgálati idő jelentős lerövidítése mellett lényegesen javítják a módszerek teljesítési jellemzőit (például érzékenység, specifi kusság) is. A polimeráz láncreakció alapú módszereknek rutindiagnosztikai célú alkalmazása azonban az előnyök mellett szá-mos hátránnyal is jár, amelyek között említendő a készülékek és a reagensek magas költsége, valamint a laboratóriumi környezetnek a reakciótermékekkel való kontaminálási kockázata, ami elkülönített laboratóriumi rendszert igényel. Manapság az ilyen laboratóriumi rendszerek miniatürizálása és hordozhatóvá tétele is fontos fejlesztési irány. A Labon-a-chip eszközökben több ilyen laboratóriumi műveletet lehet megvalósítani egy kis méretű eszközön, a standard eljárásokhoz hasonló pontossággal és megbízhatósággal. Ezen miniatürizált eszközök nagy előnye az egyszerű -sokszor automatizált -kezelhetőség, kis méret, hordozhatóság és sterilitás, ami az egyszeri használatból adódik. Ilyen miniatürizált gyorsdiagnosztikai eszközök kutatása és fejlesztése folyik a világ vezető kutatóhelyein, például különbö-ző minta-előkészítési és DNS-amplifi kációs módszerek miniatürizálásával. A szerzők is ezt a célt tűzték ki kutatásaik-ban: olyan miniatürizált mikrofl uidikai eszközök fejlesztését, amelyek alkalmasak élelmiszer-biztonsági jelentőségű baktériumok molekuláris detektálására. Orv. Hetil., 2015, 156(51), 2082-2088.Kulcsszavak: élelmiszer-biztonság, baktériumdiagnosztika, Lab-on-a-chip, mikrofl uidikai eszközök Development of molecular detection of food-borne pathogenic bacteria using miniaturized microfl uidic devicesDetection and identifi cation of food-borne pathogenic bacteria are key points for the assurance of microbiological food safety. Traditional culture-based methods are more and more replaced by or supplemented with nucleic acid based molecular techniques, targeting specifi c (preferably virulence) genes in the genomes. Internationally validated DNA amplifi cation -most frequently real-time polymerase chain reaction -methods are applied by the food microbiological testing laboratories for routine analysis, which will result not only in shortening the time for results but they also improve the performance characteristics (e.g. sensitivity, specifi city) of the methods. Beside numerous advantages of the polymerase chain reaction based techniques for routine microbiological analysis certain drawbacks have to be mentioned, such as the high cost of the equipment and reagents, as well as the risk of contamination of the labora...

show abstract

“…As molecular techniques for enterovirus typing are becoming increasing available, new enteroviruses continue to be identified. Although other molecular methods that assist serotype-specific identification have been described (2,8,18,44,47,48), nonsequencing-based molecular methods to identify more HEV serotypes/genotypes are generally limited.…”

mentioning

confidence: 99%

Molecular Identification and Analysis of Nonserotypeable Human Enteroviruses

et al. 2010

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Integrated reverse transcription polymerase chain reaction systems for virus detection☆

Cited by 115 publications

References 22 publications

Identification of 20 Common Human Enterovirus Serotypes by Use of a Reverse Transcription-PCR-Based Reverse Line Blot Hybridization Assay

Identification of 20 Common Human Enterovirus Serotypes by Use of a Reverse Transcription-PCR-Based Reverse Line Blot Hybridization Assay

Élelmiszer-biztonsági jelentőségű baktériumok molekuláris detektálásának fejlesztése miniatürizált mikrofluidikai eszközök segítségével

Molecular Identification and Analysis of Nonserotypeable Human Enteroviruses

Contact Info

Product

Resources

About