Interaction of fluorescent ATP and tRNA analogs with phenylalanyl-tRNA synthetase

Abstract

Введение. Этенопроизводные нуклеотидов широко используются для изучения структурно-функциональной топографии ферментов, зависимых от нуклеотидов [1]. Получены производные тРНК различной специфичности, содержащие остатки этеноаденозипа [2, 3]. Особый интерес представляет применение такого типа соединений в качестве аффинных реагентов для модификации белков. В работе [4] впервые обнаружена возможность ковалентного присоединения 1 ,Ы 6-этеиоадепозин-5 /-трифосфата (εΑΤΡ) к фенил аланил-тРНК синтетазе (КФ 6.1.1.20). Настоящая работа посвящена более детальному исследованию аффинной модификации фенил алан ил-тРН К синтетазы с помощью εΑΤΡ. Получены флюоресцентные аналоги τΡΗΚ ρί1β и исследовано их взаимодействие с сиптетазой.

Alterations at the 3′‐CCA end of Escherichia coli and Thermus thermophilus tRNAPhe do not abolish their acceptor activity

“…Therefore the Y-terminal adenosine provides the crucial contribution to the tRNA binding to the enzyme. The replacement of A76 by 1,N6-ethenoadenosine abolished the substrate activity and decreased the affinity 4-fold as compared to the native tRNA [14]. Yeast tRNA Phe modified in such a way has been shown to be unchargeable [11].…”

“…Earlier we studied the effect of the acceptor end change of E. coli tRNA Phe on its interaction with FRS [14]. The removal of the Y-terminal adenosine decreased the tRNA affinity to the enzyme by one order of magnitude.…”