Investigation of the sulfate-reducing bacterial community in the aerobic water and chemocline zone of the Black Sea by the fish technique

Bryukhanov, A. L.; Корнеева, В. А.; Канапацкий, Т. А.; Zakharova, E. E.; Men’ko, E. V.; Rusanov, Igor I; Pimenov, Nikolay

doi:10.1134/s002626171101005x

Cited by 18 publications

(15 citation statements)

References 18 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Клетки концентрировали на мемб-ранных фильтрах GTBP 2500 (Millipore, США). Гибридизацию осуществляли в соответствии с мето-дикой, описанной ранее [2]. Использовали мече-ные цианином-3 16S рРНК-специфичные зонды на домены Bacteria и Archaea [8] и основные филоге-нетические подгруппы СРБ [9][10][11].…”

Section: материалы и методыunclassified

“…На континенталь-ном склоне кислородсодержащие воды (~300 мкМ O 2 в подповерхностном слое) простираются до глубин 140-175 м, где концентрация кислорода падает до 2-10 мкМ. Зона хемоклина расположена обычно между 95 м (начало резкого снижения кон-центрации кислорода) и 157-167 м (присутствие следов сероводорода) [1,2]. Ниже зоны хемоклина в Черном море находится бескислородная водная толща, содержащая H 2 S (до 370 мкМ на глубинах свыше 1500 м).…”

unclassified

“…СРБ играют важнейшую роль в на-коплении H 2 S в глубинных водах Черного моря. Однако с использованием меченого 35 S-SO 4 2-было обнаружено, что в Черном море сульфатредукция происходит не только в анаэробной водной толще, но даже и в кислородсодержащих водах [2].…”

unclassified

“…Первые работы по обнаружению методом флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) клеток СРБ в кислородсодержащих горизонтах Черного моря были проведены лишь недавно [2]. Также пу-тем анализа гена 16S рРНК было показано при-сутствие эндоспор Desulfotomaculum spp.…”

unclassified

See 3 more Smart Citations

Detection of anaerobic sulfate-reducing bacteria in oxygen-containing upper water layers of the Black and Baltic Seas

Bryukhanov

Корнеева

Pimenov

2015

Moscow Univ. Biol.Sci. Bull.

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Методами флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) и ПЦР был проведен анализ фило-генетического состава сообществ анаэробных сульфатредуцирующих бактерий (СРБ) в кисло-родсодержащих верхних водных горизонтах меромиктических водоемов -Черного моря и Гданьской впадины Балтийского моря. На глубинах 30-70 м черноморского континентального склона были обнаружены клетки, гибридизовавшиеся с FISH-зондами на 16S рРНК СРБ родов Desulfotomaculum, Desulfobacter и Desulfovibrio. В зоне хемоклина Черного моря на глубине 150 м преобладали представители рода Desulfomicrobium. Помимо Desulfotomaculum (1-я подгруппа СРБ), Desulfobacter (4-я подгруппа СРБ) и Desulfovibrio-Desulfomicrobium (6-я подгруппа СРБ) посредством вложенной ПЦР с праймерами на ген 16S рРНК в кислородсодержащей водной толще Черного и Балтийского морей было обнаружено также присутствие представителей 5-й подгруппы СРБ -Desulfococcus-Desulfonema-Desulfosarcina. Из водной пробы, отобранной в Черном море с глубины 70 м, выделена активная накопительная культура СРБ, основным компонентом которой является Desulfosporosinus sp.Ключевые слова: сульфатредуцирующие бактерии, Desulfosporosinus, флуоресцентная гибри-дизация in situ, вложенная ПЦР, меромиктический водоем, Черное море, Гданьская впадина Бал-тийского моря.

show abstract

Section: материалы и методыunclassified

unclassified

See 2 more Smart Citations

Detection of anaerobic sulfate-reducing bacteria in oxygen-containing upper water layers of the Black and Baltic Seas

Bryukhanov

Корнеева

Pimenov

2015

Moscow Univ. Biol.Sci. Bull.

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Экология сульфатредуцирующих микроорганизмов чрезвычайно разнообраз-на. Они встречаются как в иловых отложе-ниях водоемов, так и в свободноплавающем виде, в геотермальных источниках, в почве различных типов, в торфяниках, а также ши-роко представлены в очистных сооружениях различного профиля и в нефтяных скважи-нах, где они образуют обрастания на трубах и способствуют их коррозии [3][4][5].…”

unclassified

Regulation of Number of Sulfate-Reducing Bacteria in Activated Sludge Under the Ozonation in Low Doses

Agasieva¹,

Golovinov²,

Sholukha³

et al. 2017

Ûg Ross.: èkol. razvit.

View full text Add to dashboard Cite

Screening and In Situ Monitoring of Potential Petroleum Hydrocarbon Degraders in Contaminated Surface Water

İçgen

Yılmaz

2016

CLEAN Soil Air Water

View full text Add to dashboard Cite

Incomplete combustion of fossil fuels and other anthropogenic activities result in contamination of surface water by petroleum hydrocarbons. These pollutants can have severe effects on aquatic life and human health. In petroleum bioremediation, oil degrading microorganisms are utilized to remove petroleum hydrocarbons from polluted water. However, monitoring and identifying microorganisms capable of degrading petroleum hydrocarbons is very challenging. In the current study, bacteria isolated from a river alongside a petroleum refinery were assessed for their petroleum hydrocarbon degradation abilities. Primary selection was performed through traditional enrichment culture method, emulsifying ability measurement, and gravimetric analysis of hydrocarbon degradation. Screening of two novel hydrocarbon catabolism genes encoding key enzymes in hydrocarbon degradation, alkB and C23O, was performed by using polymerase chain reaction. The bacterial isolates, degrading hydrocarbons with high emulsification abilities and harboring the catabolic genes, were identified as species of Acinetobacter by 16S rRNA sequence analysis. Monitoring the temporal distribution of Acinetobacter in river water was also done by fluorescence in situ hybridization using DNA probe ACA652. The results revealed that species of Acinetobacter successfully populate the polluted surface water and have high potential for petroleum bioremediation.

show abstract

Investigation of the sulfate-reducing bacterial community in the aerobic water and chemocline zone of the Black Sea by the fish technique

Cited by 18 publications

References 18 publications

Detection of anaerobic sulfate-reducing bacteria in oxygen-containing upper water layers of the Black and Baltic Seas

Detection of anaerobic sulfate-reducing bacteria in oxygen-containing upper water layers of the Black and Baltic Seas

Regulation of Number of Sulfate-Reducing Bacteria in Activated Sludge Under the Ozonation in Low Doses

Screening and In Situ Monitoring of Potential Petroleum Hydrocarbon Degraders in Contaminated Surface Water

Contact Info

Product

Resources

About