2004
DOI: 10.1111/j.1471-8286.2004.00641.x
|View full text |Cite
|
Sign up to set email alerts
|

Isolation and characterization of polymorphic microsatellites for assessment of genetic variation of hops (Humulus lupulus L.)

Abstract: Hop (Humulus lupulus L.) cultivars are vegetatively propagated and it is difficult to differentiate them during the process of propagation. Fingerprinting with molecular markers based on DNA could be a useful means of identifying different cultivars. Simple sequence repeats, or microsatellite markers, are the most suitable marker for genetic fingerprinting because they are multi‐allelic and co‐dominant. For this purpose, we have developed primers for 10 new polymorphic microsatellite loci that are suitable for… Show more

Help me understand this report

Search citation statements

Order By: Relevance

Paper Sections

Select...
2
1

Citation Types

1
18
0
3

Year Published

2009
2009
2020
2020

Publication Types

Select...
8

Relationship

0
8

Authors

Journals

citations
Cited by 28 publications
(22 citation statements)
references
References 8 publications
1
18
0
3
Order By: Relevance
“…Standardně se však využívají přímo v reakcích jednoduchých sekvenčních repetic (SSR). Proto byly a jsou SSR markery nejpoužívanější pro genotypování a studium molekulární variability u chmele (Jakše et al, 2001;2002;Čerenak et al, 2004;Hadonou et al, 2004;Murakami et al, 2006a;Bassil et al, 2008;Štajner et al, 2005;Peredo et al, 2010;Patzak et al, 2010a;Horreo et al, 2014;Karlsson Strese et al, 2014;Mongelli et al, 2015;Korbecka-Glinka et al, 2016). Většina SSR markerů se nachází v nekódujících oblastech genomu.…”
Section: ■ 3 Genetické Metodyunclassified
“…Standardně se však využívají přímo v reakcích jednoduchých sekvenčních repetic (SSR). Proto byly a jsou SSR markery nejpoužívanější pro genotypování a studium molekulární variability u chmele (Jakše et al, 2001;2002;Čerenak et al, 2004;Hadonou et al, 2004;Murakami et al, 2006a;Bassil et al, 2008;Štajner et al, 2005;Peredo et al, 2010;Patzak et al, 2010a;Horreo et al, 2014;Karlsson Strese et al, 2014;Mongelli et al, 2015;Korbecka-Glinka et al, 2016). Většina SSR markerů se nachází v nekódujících oblastech genomu.…”
Section: ■ 3 Genetické Metodyunclassified
“…Pro molekulární analýzy byly použity SSR metoda (Hadonou et al ., 2004), STS a EST-SSR markerovací systémy (Patzak a Matoušek, 2011) . Typická PCR reakce probíhala za následujících amplifikačních podmínek: 2 min při 94 °C, 35 cyklů (30 s při 94 °C; 60 s při 54 °C, 90 s při 72 °C); 10 min při 72 °C .…”
Section: Genetická Charakteristikaunclassified
“…For molecular analyses, SSR (Hadonou et al ., 2004), STS and EST-SSR marker systems were used (Patzak and Matoušek, 2011) . For a typical PCR reaction (Taq PCR master mix kit, Qiagen, Hilden, FRG) we used the following amplification conditions: 2 min at 94 °C, 35 cycles/ (30 s at 94 °C; 60 s at 54 °C, 90 s at 72 °C); 10 min at 72 °C .…”
Section: Genetic Characteristicmentioning
confidence: 99%
“…Nejspolehlivějším postupem pro molekulárně genetickou charakterizaci genotypů chmele a hodnocení jejich variability a biodiversity je metoda SSR (jednoduché sekvenční repetice). Mnoho SSR markerů bylo již pro chmel specifikováno [21][22][23]. V našich předešlých pracích jsme připravili účinný SSR markerovací systém pro genotypizaci českých odrůd chmele [24].…”
unclassified
“…The SSR (Simple Sequence Repeat) method is the most reliable one for the molecular genetic characterization of hop genotypes and the evaluation of their variability and biodiversity. The many of SSR markers have been characterized in hop [21][22][23]. In our previous works, we prepared the efficient SSR marker system for genotyping of Czech hop cultivars [24].…”
mentioning
confidence: 99%