Isolation of Bacteria from the Rhizosphere and Rhizoplane of Potato (Solanum tuberosum) Grown in Two Distinct Soils Using Semi Selective Media and Characterization of Their Biological Properties

Turnbull, Amy L.; Liu, Yibin; Lazarovits, George

doi:10.1007/s12230-012-9253-4

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“…The plants were removed with intact roots and root zone soil were collected in a sterile container and kept at 4°C for further processing (Turnbull et al, 2012). Ten gram of each soil samples was incubated at 60°C for 40 min and re-suspended in 50 ml of saline.…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

“…Rhizosphere soil of five different medicinal plants ( Solanum trilobatum, Ocimum tenuiflorum, Cardiospermum halicacabum, Justicia adhatoda , and Wedelia chinensis ) were collected from local medicinal plant garden. The plants were removed with intact roots and root zone soil were collected in a sterile container and kept at 4°C for further processing ( Turnbull et al, 2012 ). Ten gram of each soil samples was incubated at 60°C for 40 min and re-suspended in 50 ml of saline.…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

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Bioactive Molecule from Streptomyces sp. Mitigates MDR Klebsiella pneumoniae in Zebrafish Infection Model

et al. 2017

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The emergence and spread of multi-drug resistant (MDR) especially carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae is a major emerging threat to public health, leading to excess in mortality rate as high as 50–86%. MDR K. pneumoniae manifests all broad mechanisms of drug resistance, hence development of new drugs to treat MDR K. pneumoniae infection has become a more relevant question in the scientific community. In the present study a potential Streptomyces sp. ASK2 was isolated from rhizosphere soil of medicinal plant. The multistep HPLC purification identified the active principle exhibiting antagonistic activity against MDR K. pneumoniae. The purified compound was found to be an aromatic compound with aliphatic side chain molecule having a molecular weight of 444.43 Da. FT-IR showed the presence of OH and C=O as functional groups. The bioactive compound was further evaluated for drug induced toxicity and efficacy in adult zebrafish infection model. As this is the first study on K. pneumoniae – zebrafish model, the infectious doses to manifest sub-clinical and clinical infection were optimized. Furthermore, the virulence of K. pneumoniae in planktonic and biofilm state was studied in zebrafish. The MTT assay of ex vivo culture of zebrafish liver reveals non-toxic nature of the proposed ASK2 compound at an effective dose. Moreover, significant increase in survival rate of infected zebrafish suggests that ASK2 compound from a new strain of Streptomyces sp. was potent in mitigating MDR K. pneumoniae infection.

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Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Bioactive Molecule from Streptomyces sp. Mitigates MDR Klebsiella pneumoniae in Zebrafish Infection Model

et al. 2017

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“…A coleta de amostras de solos de ambiente rizosférico e não rizosférico foi realizada em parcela (27,5 m 2 ) com cultivo de milho (Zea mays L., híbrido DKB 240 VT PRO ® ) em sistema de plantio direto não consolidado, no sul do Brasil, sendo o solo classificado como Latossolo Vermelho distroférrico típico (EMBRAPA 2013). Para o solo rizosférico, plantas (n = 4) foram cuidadosamente removidas do solo, e o solo frouxamente aderido às raízes foi removido por agitação manual (TURNBULL et al 2012). O solo do ambiente rizosférico foi coletado utilizando espátulas estéreis.…”

Section: Coleta De Solo Rizosférico E Não Rizosférico E Processamento Das Amostrasunclassified

Diversidade funcional de bactérias isoladas de solos rizosférico e não rizosférico em cultura de milho

Ramos

Sobucki

Rohrig

et al. 2018

Rev. Cienc. Agrovet.

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Este estudo avaliou os potenciais hidrolítico e de solubilização de fosfato de bactérias isoladas de Latossolo Vermelho cultivado com milho. A coleta de solo rizosférico (SR) e solo não rizosférico (NR) foi realizada, sendo procedido o isolamento de colônias bacterianas em culturas puras. Meios de cultura sólidos foram utilizados na avaliação da produção de hidrolases e solubilização de fosfato pelos isolados. A partir de SR e NR foram isolados 30 e 19 tipos coloniais distintos, respectivamente. De 29 isolados de SR, 68,9%, 65,5%, 20,7% e 24,1% apresentaram atividade proteolítica, celulolítica, amilolítica e solubilização de fosfato, respectivamente. Dos isolados de NR, 57,9% produziram celulase, 42,1% protease, 57,9% amilase e 21,0% solubilizaram fosfato; contudo, 31,6% destes isolados não demonstraram qualquer atividade. Diversas bactérias apresentaram atividades combinadas, representado aproximadamente 58% dos isolados de SR e NR. Além da relevância ambiental e agrícola, a habilidade microbiana em secretar enzimas relacionadas ao ciclo do carbono e nitrogênio e a solubilização de fosfato podem ser importantes na perspectiva biotecnológica.

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“…A opção por tais meios de cultivo se apresenta como principal vantagem para a obtenção de grupos microbianos específicos, como os diazotróficos, solubilizadores de fosfato, produtores de sideróforos, entre outros. (PENROSE e GLICK, 2003;TURNBULL et al, 2012). De qualquer modo, a maioria das estirpes utilizadas em formulações inoculantes comerciais foram obtidas a partir de estudos de bioprospecção, utilizando material vegetal coletado sob condição de cultivo comercial ou a partir da comunidade vegetal natural (ROSENBLUETH e MARTÍNEZ-ROMERO, 2006).…”

Section: Isolamento De Bpcvsunclassified

Aplicações da biodiversidade bacteriana do solo para a sustentabilidade da agricultura

Oliveira¹,

Costa²,

Ferreira³

et al. 2014

BBR - Biochem. Biotechnol.

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Brazilian agribusiness is of great competitivity mostly due to the lack of government subsidies and the historical efforts made in research and development by the public institutes and Universities. Nevertheless the Brazilian agriculture is fundamented in the use of fertilizers and agrochemicals that needs to be imported in huge amounts to supply the Brazilian farmers. In this sense, the safety and sustainability of the Brazilian agribusiness is subjected to the supply of these inputs and to the prices prevailing on the international market. In addition, a new concern is emerging in the global society, which has increased demands for food, feed, and energy that must be provided by the agriculture, although new sustainable farming practices urge to be implemented. Natural relationships between plants and soil microbes are on the heart of the matter, with growing scientific data supporting the use of the former-potential plant-bacteria associations in large scale to increase the crop productivity and hence the production of food and energy. The total substitution of nitrogen fertilizers in soybean crops by the biological nitrogen fixation held by rhizobia corroborates the efficiency of such associations, and point out for the need to expand this and other natural mechanisms directed to provide nutrients to cereals and other nonleguminous crops. To achieve this, much effort is also needed to reach a better understanding of the mechanisms controlling plant-bacteria associations, and to develop biofertilizer formulations presenting a high efficiency under a myriad of field conditions, as those found in Brazil. Biotechnological approaches aimed to reach this goal are reviewed and discussed throughout this manuscript. Keywords:Biofertilizer, plant growth-promoting bacteria, plant nutrition, plant inoculation. __________________________Universidade Estadual de Londrina, Departamento de Bioquímica e Biotecnologia, Rodovia Celso Garcia Cid (PR 445), km 380, Campus Universitário, Cx. Postal 6001, Londrina, Paraná, Brasil. *Autor para correspondência: Telefone: (43) 33715473, Fax: (43) 33714440, email: almoliva@uel.br RESUMO O agronegócio brasileiro possui grande competitividade internacional, principalmente pelos esforços historicamente dispendidos por institutos públicos de pesquisa e Universidades. No entanto, muito dos avanços obtidos pelo agronegócio brasileiro é decorrente do uso em larga escala de fertilizantes e agroquímicos, que devem necessariamente ser importados em grandes quantidades para suprir a demanda dos agricultores brasileiros. Neste sentido, a segurança e a sustentabilidade do agronegócio brasileiro estão ameaçadas pela disponibilidade e susceptibilidade destes insumos aos preços praticados pelo mercado internacional. Além disso, a sociedade global apresenta uma nova apreensão quanto à necessidade de alcançar produtividades mais elevadas e de uma maneira mais sustentável, para prover a população crescente com alimentos e energia. As relações naturais existentes entre as plantas e a microbio...

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Isolation of Bacteria from the Rhizosphere and Rhizoplane of Potato (Solanum tuberosum) Grown in Two Distinct Soils Using Semi Selective Media and Characterization of Their Biological Properties

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Bioactive Molecule from Streptomyces sp. Mitigates MDR Klebsiella pneumoniae in Zebrafish Infection Model

Bioactive Molecule from Streptomyces sp. Mitigates MDR Klebsiella pneumoniae in Zebrafish Infection Model

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Aplicações da biodiversidade bacteriana do solo para a sustentabilidade da agricultura

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