La enfermedad granulomatosa crónica (ECG) es un error innato de la inmunidad que afecta la funcionalidad de la fagocitosis, específicamente hay una falta de producción de radicales libres de oxígeno por la NADPH oxidasa. La EGC se manifiesta con infecciones bacterianas y fúngicas, recurrentes y graves e hiperinflamación local y sistémica. En países en donde la tuberculosis es endémica y la vacuna BCG es obligatoria al nacer, los pacientes con EGC pueden presentar como primera manifestación las reacciones locales o sistémicas a esta vacuna y además a lo largo de su vida infecciones recurrentes por M. tuberculosis. La susceptibilidad de estos pacientes a micobacterias es debida a la producción excesiva de citocinas proinflamatorias y la formación de granulomas ineficientes en la contención de la micobacteria. En los países desarrollados, los pacientes con EGC no presentan este tipo de manifestaciones infecciosas, salvo los migrantes de países en desarrollo. En esta revisión, presentamos las características de las infecciones por BCG, M. tuberculosis y otras micobacterias. Interesantemente no existen lineamientos en cuanto a los tratamientos antituberculosos en pacientes con EGC, por lo que proponemos realizar un consenso por expertos para establecer lineamientos para el tratamiento de la enfermedad por micobacterias en EGC.