WUSCHEL RELATED HOMEOBOX 5 (WOX5) gene en codes the transcription factor, which is one of the key regulators, maintaining structure and functioning of the stem cell niche in plant root tips. Protein WOX5 is expressed in the quiescent center of the root apical meristem, preventing differentiation of columella initials and altogether with SCR, SHR, PLT1 and PLT2 participating in the control of differentiation of other root meristem initials. However, the details of WOX5 functioning are unclear. The WOX5 protein belongs to WUSCHEL related homeobox (WOX) family, the founder of which is the transcription factor WUSCHEL (WUS) providing maintenance of the stem cell niche in the shoot apical meristem. WOX5 and WUS diver ged from a common ancestor at the base of angiosperms, which resulted in a spe cialization of shoot and root stem cell niches. How ever, the problem of WOX5 structural and functional divergence during angiosperm evolution was poorly addressed. In this review we present a systems bio logy analysis of the WOX5 gene to reveal specific features of its evolution and functioning. To this end, we performed a phylogenetic analysis on 62 publicly available WOX5 amino acid sequences, generalized published data about WOX5 expression domain in Arabidopsis and other species and its role in deve lopment, integrated the results of experiments on identification of primary and secondary targets for this transcription factor. Data on possible mecha nisms of direct and indirect regulation of WOX5 expression were discussed. Particularly, we per form ed the analysis of WOX5 promoter regions from 30 species. Possible direct regulators of the WOX5 gene expression were proposed based on the presen ce Ген WUSCHEL RELATED HOMEOBOX 5 (WOX5) кодирует транскрип ци онный фактор, который является одним из основных регуляторов поддержания структуры и функционирования ниши стволовых клеток в кончике корня растений. Белок WOX5 экспрессируется в клетках покоящегося центра апикальной меристемы корня, предотвращая дифференцировку прилегающих к нему инициа лей колумеллы и участвуя наряду с SCR, SHR, PLT1, PLT2 в контроле дифференцировки других инициалей меристемы корня. Однако детали механизмов функционирования этого белка неясны. WOX5 относится к семейству WUSCHEL related homeobox (WOX), родоначальник которого, транскрипционный фактор WUSCHEL (WUS), обеспечивает поддержание ниши стволовых клеток в меристеме побега. Считается, что ген WOX5 дивергировал от общего с WUS предка у древних покрытосеменных, в резуль тате чего произошла специализация ниш стволовых клеток побега и корня. Однако вопрос дальнейшей дивергенции структуры и функций WOX5 в процессе эволюции цветковых растений изучен слабо. В данном обзоре представлен системно биологический анализ гена WOX5 с целью выявления особен но с тей его эволюции и механизмов функционирования. Для этого в работе прове ден филогенетический анализ 62 аминокислотных последовательностей WOX5 из публично доступных баз данных, обобщены ли те ратурные данные о домене экспрессии WOX5 у арабидопсиса и других...