Mitochondrial haplotype variation and phylogeography of Iberian brown trout populations

Machordom, Annie; Súarez, Juan E.; Almodóvar, Ana; Bautista, José M.

doi:10.1046/j.1365-294x.2000.01015.x

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“…In fact, some samples clustered together with those of other populations, showing a clustering pattern that was not related to the basin to which they belonged. Similar observations have been reported for some wild and hatcheries populations of S. trutta in Greece (Apostolidis et al 1996), Spain (Machordom et al 2000) and Italy (Caputo et al 2004). In all such cases, the absence of correlation between geographical distribution and genetic relatedness can be attributed to allochthonous stocking material (Caputo et al 2004).…”

Section: Discussionsupporting

confidence: 82%

Genetic characterization of a putative indigenous brown trout (Salmo truttafario) population in a secondary stream of the Nera River Basin (Central Italy) assessed by means of three molecular markers

Lucentini

Palomba

Gigliarelli

et al. 2006

Italian Journal of Zoology

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Genetic diversity was analysed in a putative autochthonous brown trout (Salmo trutta fario L.) population (Monterivoso Stream, Tyrrhenian Apennine Slope) by means of seven microsatellite loci and PCR-RFLP of two mitochondrial (ND1 and ND5/6) and one nuclear (LDH-C1*) locus. Monterivoso data were compared to those obtained analysing populations of the same basin (Nera River) and of the Po basin; Irish populations were used as a source of Atlantic strain brown trout. Haplotypes distributions, heterozygosity, F-statistic and UPGMA analyses indicated a genetic diversification between these populations, suggesting a widespread alteration of the genetic structure due to repeated stocking with allochthonous material, mainly of Atlantic origin, that has partially polluted the Monterivoso population. This population appeared to be constituted of Mediterranean strain samples and might represent a residue of an indigenous pool: it shows high specificity characteristics and it is genetically separate from the others observed and from populations of the Adriatic slope of the Apennines. This population should be employed in managing and breeding programmes finalised to an eco-sustainable restocking of brown trout in the Nera River Basin, with periodic monitoring by genetic analyses.

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Section: Discussionsupporting

confidence: 82%

Genetic characterization of a putative indigenous brown trout (Salmo truttafario) population in a secondary stream of the Nera River Basin (Central Italy) assessed by means of three molecular markers

Lucentini

Palomba

Gigliarelli

et al. 2006

Italian Journal of Zoology

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“…Doadrio, 1988;Dennis et al, 1998;Puente et al, 1998;Vargas et al, 1998;Ribera, 2000;García-Barros et al, 2002) and in establishing the origin of selected Iberian taxa and their phylogenetic and phylogeographic relationships, mainly with molecular methods (e.g. Ferris et al, 1998;Frati et al, 1998;Arntzen & Wallis, 1999;García-París & Jockusch, 1999;Lenk et al, 1999;Alexandrino et al, 2000;Gómez-Zurita et al, 2000;Machordom et al, 2000;Oliverio et al, 2000;Seddon et al, 2001;Branco et al, 2002;Ribera et al, 2003a;see Hewitt, 1999, 2000 for reviews). There is, however, a paucity of studies bringing together these two approaches, that is, searching for general patterns in the origin and the phylogenetic and phylogeographic relationships in relatively rich groups of organisms with Iberian representation (but see e.g.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Are Iberian endemics Iberian? A case-study using water beetles of family Dytiscidae (Coleoptera)

Ribera¹

2003

GRAELLSIA

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The phylogenetic relationships and the geographical origin of 27 of the 34 species and of 3 of the 9 subspecies of Iberian endemic Dytiscidae are studied, based on species level phylogenies constructed with two mitochondrial gene fragments (16S rRNA and Cytochrome Oxidase I). All Iberian endemic species for which more than one specimen was included were monophyletic with the exception of the complex Deronectes aubei sanfilippoi Fery & Brancucci, 1997-D. delarouzei (Jac. Du Val, 1857 (Sharp, 1872) and Hydroporus normandi normandi Régimbart, 1903 do not form well characterised lineages, as measured with the mitochondrial markers used in this study.The Iberian endemic species of Dytiscidae are divided in three groups according to the type of vicariant origin: 1) within-Iberian species, when the sister species (or clade) of the Iberian endemic is also and Iberian endemic; 2) Iberian/European, when the sister occurs in Europe north of the Pyrenees; and 3) Iberian/North African, when the sister occurs in North Africa. Within-Iberian endemics are found to be on average older than Iberian/European and Iberian/North African species, they have more restricted distributions within the Iberian peninsula (they occur typically in only one of the main biogeographical regions), and tend to occur exclusively in running waters. The withinIberian species are best represented by the "Iberian" clade of the genus Deronectes, formed by six endemic species plus two species with wider distributions. Most species in this group originated in rapid succession in the Late Miocene-Early Pliocene boundary by repeated vicariant events in the three main mountain massifs in the Iberian peninsula: the Pyrenees, the Baetic ranges, and the Sistema Central plus mountain massifs of the NW. On the contrary, most of the Iberian/European species seem to be the recent (Pleistocene) vicariants of a species with a widespread distribution encompassing the Iberian peninsula, at present restricted to south and west of the Ebro valley. The results of these analyses suggest that the Iberian peninsula was an isolated refuge during the Quaternary glaciations, in where allopatric speciation was frequent among some lineages of Dytiscidae diving beetles.

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“…En los últimos años, los avanzados estudios genéticos sugieren una gran diversidad evolutiva de la trucha común en los países mediterráneos del sur de Europa (García-Marín et al, 1999;Machordom et al, 2000). Sólo en la Península Ibérica, Machordom et al (2000) establecieron cinco linajes distintos según la distribución haploide y la biogeografía Ibérica.…”

Section: Discussionunclassified

“…Sólo en la Península Ibérica, Machordom et al (2000) establecieron cinco linajes distintos según la distribución haploide y la biogeografía Ibérica. Nuestro estudio está encuadrado en poblaciones filogeográficas del tipo mediterráneo, residentes dentro de un área de distribución geográfica muy pequeña.…”

Section: Discussionunclassified

“…Debido al gran desarrollo de las técnicas genéticas en los últimos tiempos y a su rápida aplicación a los peces, hoy en día sabemos cómo han evolucionado las poblaciones de truchas en la Península Ibérica. Machordom et al (2000) muestran cinco linajes o distribuciones biogeográficas de las poblaciones de trucha autóctona, dependiendo del contenido genético haploide del ADN mitocondrial. Estos linajes corresponderían a las cuencas o 12 ríos donde habitan; los ríos meridionales andaluces, los que desembocan en el mar Cantábrico y en el Mediterráneo y las cuencas del Duero y del Tajo.…”

Section: Capítulo 1 Introducción Y Objetivos Introducción Generalunclassified

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Estado de las poblaciones de trucha en los ríos de la Comunidad Valenciana y caracterización de sus hábitats

Hernández¹,

Diego²

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Queda prohibida la reproducción, distribución, comercialización, transformación, y en general, cualquier otra forma de explotación, por cualquier procedimiento, de todo o parte de los contenidos de esta obra sin autorización expresa y por escrito de sus autores.A Gisela y Arturo.Mi pequeño clan. AGRADECIMIENTOSMe acuerdo el día en el que conocí a Paco, mi tutor. Él acababa de llegar a la Universidad Politécnica de Valencia como profesor interino, era joven y apenas tenía unos pocos años más que yo. Iba buscando a una persona para trabajar con él. Bastaron unas pocas palabras para convencerme y juntos formamos un pequeño grupo de investigación muy joven, casi adolescentes, si nos comparamos con las largas trayectorias de los científicos. Se debió correr la voz de la creación de este nuevo grupo por lo largo y ancho del planeta, porque al poco llego desde las costas de Chile, un nuevo doctorando, Matías. Mano a mano, estuvimos trabajando durante más de año antes de que llegara Aina (para los amigos Divaina). Paco me introdujo en el fascinante mundo de los ríos y de los peces. A él le debo el que yo haya realizado esta tesis. Mis socios en esta empresa, Paco, Matías y Aina compartieron conmigo mis sueños y mis desvelos, solventados muchas veces con una copita de pacharán. Con el tiempo y poco a poco, el grupo fue creciendo paulatinamente aumentando la calidez humana. Las nuevas incorporaciones de Virginia, Marta, Manu, Rui, Rafa y Julia me aportaron nuevas ideas e ilusiones. A todos ellos, mil gracias.En el largo peregrinaje que es el hacer una tesis me encontré por el camino a mucha gente, que sin pedir nada a cambio me ayudaron desinteresadamente, muchas veces sin que ni ellos lo supieran o se dieran cuenta. Entre ellos está la guardería forestal del Rincón de Ademuz, especialmente a los agentes medioambientales Germán Francés y José Urbano, que aportaron profesionalidad en los trabajos de campo. A Carlos Alonso González, por su ayuda en el cálculo de densidades. De la misma manera, quisiera mencionar a Toni Pradillo y Roberto Coll que consiguieron trasmitirme su gran pasión, la pesca. Además, quisiera agradecer a Roberto Coll por luchar, desde su blog pescaturia, por la dignidad de los ríos mediterráneos y por el estudio genético de las poblaciones de trucha común en ríos valencianos. A Mercedes Arenas, Consuelo Pérez, Pau Lucio, Rafa Casas, Rosa de la Salud, Pascual Puerto, Javier Izquierdo, Jaime Ramos, Laura Gómez, Fran Pardavila, Sasa Plestenjak y Bego Monroig (perdonadme si a alguien no nombro) por transformarse, en las infinitas salidas al campo, en tramperos por unos días para realizar la pesca eléctrica o incluso en buzos (sin escafandra).No quisiera olvidarme de Juan Theureau que desde la Consellería de Medio Ambiente, Agua, Urbanismo y Vivienda de la Generalitat Valenciana de la Generalitat Valenciana consiguió gran parte de la financiación para que esta aventura, que partió con un estudio para la administración, llegara a buen puerto. Como tampoco del profesor Derek H. Orgle (Northland Collage, EE.UU)...

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Mitochondrial haplotype variation and phylogeography of Iberian brown trout populations

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Genetic characterization of a putative indigenous brown trout (Salmo truttafario) population in a secondary stream of the Nera River Basin (Central Italy) assessed by means of three molecular markers

Genetic characterization of a putative indigenous brown trout (Salmo truttafario) population in a secondary stream of the Nera River Basin (Central Italy) assessed by means of three molecular markers

Are Iberian endemics Iberian? A case-study using water beetles of family Dytiscidae (Coleoptera)

Estado de las poblaciones de trucha en los ríos de la Comunidad Valenciana y caracterización de sus hábitats

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