Molecular ecology of the Neotropical otter (Lontra longicaudis): non-invasive sampling yields insights into local population dynamics

Abstract

Non‐invasive genetic analysis has been frequently employed to estimate ecological and population parameters for many secretive and/or threatened species. However, Neotropical carnivores have so far been scarcely targeted by such studies. The Neotropical otter (Lontra longicaudis) is a poorly‐known species for which local levels of genetic diversity and demographic parameters are virtually absent. We employed non‐invasive sampling and amplification of microsatellite loci to investigate population size and density, spatial organization, and relatedness of a wild Neotropical otter population in an Atlantic forest area in southern Brazil. We directly identified 28 individuals and estimate a rather high population density at the study site. Spatial organization analysis indicated that male cumulative displacement was higher than that of females, with the latter sex showing evidence of philopatric behaviour. Also, the reconstruction of genealogical relationships suggests that spatial organization in this otter appears to be influenced by relatedness. By allowing the testing of specific hypothesis targeting these issues, our results provided important glimpses into the Neotropical otter's population biology. Moreover, the findings of the present study reaffirm the power of non‐invasive genetics to investigate the biology of this elusive species, and open up new avenues for ecological and demographic studies of other Neotropical carnivores. © 2013 The Linnean Society of London, Biological Journal of the Linnean Society, 2013, 109, 932–948.

Impacto de um desastre natural sobre o habitat e a ocorrência de Lontra longicaudis (Mustelidae, Carnivora) na Serra da Prata, Paraná, Brasil

“…Putman (1984), as fezes são um importante meio utilizado pelos mamíferos para a marcação de território. Apesar de não ser possível estimar a população da espécie no Rio das Pombas (controle) sem um método específico para este objetivo, como o uso do DNA presente nas fezes (Trinca et al, 2007(Trinca et al, , 2013, a ocorrência da lontra nesse rio foi confirmada por meio de expressiva quantidade de amostras fecais, evidenciando que este possui características ambientais favoráveis à ocupação pela espécie.…”

Aportes de la genética de la conservación al estudio de los mamíferos neotropicales: revisión y análisis crítico

“…Las técnicas no invasivas de muestreo genético se utilizan para realizar diversos estudios en distintas especies de mamíferos neotropicales (González and Barbanti Duarte 2007;RuizGarcía et al 2007;Trinca et al 2013;Rodgers and Janečka 2013;Grattarola et al 2015;Byrne et al 2015;Trigila et al 2016). Particularmente, para los mamíferos se han realizado distintos esfuerzos por optimizar la obtención de ADN a partir de pelos y heces.…”

Uso do espaço pelo veado-catingueiro (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814): uma comparação entre colares GPS e DNA fecal

“…Leeuwenberg et al (1999) Um avanço considerável no uso de amostras fecais foi a identificação individual a partir de genotipagens com marcadores microssatélites (TABERLET, 1997). Apesar de seu uso remeter há quase duas décadas e serem inúmeros os trabalhos realizados pelo mundo, o presente trabalho é apenas o sexto a ser realizado no Brasil (MIOTTO et al, 2012;MANTELLATTO, 2011;MICHALSKI et al, 2011;OLIVERIA;TRINCA et al, 2013). O sucesso encontrado aqui foi de 12% de amplificação e 5% de amostras identificadas.…”

“…Há muito tempo as fezes representam a melhor fonte de informação para mastozoólogos de campo frustrados por não poderem capturar ou visualizar seus animais de interesse (PUTMAN, 1984 , 2009;POMPANON et al, 2012;TRINCA et al, 2013;DEMAY et al, 2014).…”

“…A análise do DNA contido nas fezes tornou-se uma ferramenta importante, pois ampliou as possibilidades de estudos de comportamento, demografia, uso do espaço, dieta, doenças, variabilidade genética e filogenia (KOHN; WAYNE, 1997). Informações populacionais, como dispersão, estrutura e organização social, antes só possíveis de serem obtidas com um número alto e inviável de animais marcados, passam a ser possíveis através da amostragem fecal (SIMTH et al, 2006;TRINCA et al, 2013). Apesar dessa diversidade de aplicações, pode-se dizer que o DNA fecal ainda é uma metodologia subutilizada e as técnicas de amostragem e os vieses envolvidos, pouco explorados (WAITS; PAETKAU, 2005).…”