Multilocus phylogeographical analysis of Trypanosoma (Megatrypanum) genotypes from sympatric cattle and water buffalo populations supports evolutionary host constraint and close phylogenetic relationships with genotypes found in other ruminants

Congopain genes diverged to become specific to Savannah, Forest and Kilifi subgroups of Trypanosoma congolense, and are valuable for diagnosis, genotyping and phylogenetic inferences

“…using RAxML v.7.0 as described in our previous studies (Garcia et al, 2011b;Lima et al, 2012;Rodrigues et al, 2010).Phylogenetic trees were constructed using the Neighbor-Net method with Kimura 2 parameters implemented in Splits Tree4 V4.10 ( Huson and Bryant, 2006). Internode support was estimated by performing 100 bootstrap replicates using the same parameters optimised for tree inferences.…”

Spliced Leader (SL) RNA: análises de genes e regiões intergênicas com aportes na filogenia, taxonomia e genotipagem de <i>Trypanosoma</i> spp. de todas as classes de vertebrados.

“…Eventos de co-evolução não foram comprovados, embora eventos de co-divergência não sejam raros (Hamilton et al, 2007). Entretanto, embora algumas espécies sejam generalistas, infectando hospedeiros de diferentes ordens/famílias, alguns clados observados nas árvores filogenéticas apresentam uma forte associação com espécies da mesma ordem ou família, de hospedeiros vertebrados ou de invertebrados (Hamilton et al, 2007(Hamilton et al, , 2012Viola et al, 2009a,b;Cavazzana et al, 2010;Garcia et al, 2011;Lima et al, 2012). A inclusão de novas espécies de tripanossomas em árvores filogenéticas tem demonstrado que a história evolutiva desses organismos é bastante complexa e que, aparentemente, os diversos clados, estabelecidos nas árvores filogenéticas baseadas nos genes SSU rRNA e gGAPDH, não evoluíram segundo um modelo evolutivo comum, parecendo mais terem sido moldados por diversos eventos evolutivos.…”

“…A transmissão dá-se pela via contaminativa, tal como acontece com os tripanossomas do grupo Stercoraria, pela penetração de tripomastigotas metacíclicos (presentes nas fezes do vetor) em mucosas ou lesões; o animal pode também infectar-se pela ingestão das fezes ou do próprio vetor (Rodrigues et al, 2006(Rodrigues et al, , 2010Garcia et al, 2011).…”

“…A associação genótipo-hospedeiro foi comprovada pela divergência de tripanossomas isolados de gado e búfalo de uma mesma região e pelo agrupamento em um mesmo genótipo (TthIA) de isolados de búfalo provenientes de diferentes regiões geográficas (Rodrigues et al, 2006(Rodrigues et al, , 2010Garcia et al, 2011). O clado T. cyclops, um grupo pouco conhecido e filogeneticamente relacionado com o clado T.…”

“…A análise do polimorfismo da região intergênica tem permitido também avaliar o repertório de genótipos de uma determinada espécie, como descrito para: T. rangeli (Grisard et al, 1999;Maia da Silva et al, 2007;T. vivax (Ventura et al, 2000); T. theileri (Rodrigues et al, 2010;Garcia et al, 2011) e T. cruzi (Souto et al, 1996;Nunez et al, 1997;Fernandes et al, 1998Fernandes et al, , 2001Brisse et al, 2001;O'Connor et al, 2007;Herrera et al, 2009Herrera et al, , 2013Cura et al, 2010;Lima et al, 2015b). …”