Next-Generation Gene Sequencing and Its Applications in Oncohematology

Abstract

Key words: next generation sequencing, technologies, leukemia, gene mutations, bioinformaticsВведение Общеизвестно, что развитие злокачественных опухолевых заболеваний системы крови связано с воз-никновением ряда последовательных мутаций генов, ведущих к развитию злокачественного клеточного клона.Известно также, что в процессе терапии первичная популяция злокачественных клеток может приобретать вторичные мутации, изменяясь под влиянием различных факторов отбора в организме больного (иммунологиче-ская селекция, действие цитостатических препаратов и др.). Эти злокачественные субклоны с сочетаниями генных мутаций могут впоследствии приводить к ре-цидивам заболевания. Разнообразие генной патологии в организме больного существенно влияет на прогноз и исходы лечения больных с лейкозами и лимфомами. Для оценки клинического риска в каждом конкретном случае требуется детальная характеристика генетических аберраций, а для этого необходимо определение по-следовательности нуклеотидов целевого гена в злока-чественных клетках.Современная молекулярная диагностика при лей-козах основана на выявлении конкретных генных мутаций, характерных для того или иного вида лейко-за. Основным методом является молекулярно-генети-ческая диагностика на базе полимеразной цепной реакции (ПЦР) с анализом целевых участков генов, которая проводится в лабораториях крупных онкоге-матологических клиник. Кроме того, с начала 1990-х годов для задач дешифровки генов, в первую очередь смысловых последовательностей (сиквенсов) молекул матричной РНК (мРНК), применяли главным образом классическое секвенирование по Сэнгеру. Проект «Ге-ном человека», основной задачей которого была сбор-ка референсной последовательности человеческого