AgradecimentosÀ Denise de Castro Fernandes pela orientação, inspiração, compreensão e apoio em todos os momentos nessa fase, exemplo de pessoa que sempre irei me inspirar.Ao Prof. Francisco Laurindo pelo apoio e as conversas científicas, que me inspiraram sobre o que é realmente fazer ciência.À minha família (Cecília, Eduardo, Marcela, Yoshio e Ytiro) pelo apoio e compreensão incondicional.Ao Danilo por estar ao meu lado, com carinho e compreensão, nesta etapa que certamente será importante para futuras etapas em nossa vida.Ao João Wosniak Jr pelo apoio e ajuda cultivo celular, na otimização de condições experimentais e em todas as minhas apresentações.À Maria Bertoline, que sempre me ajudou no HPLC e pela carinhosa companhia no laboratório.Aos colegas de laboratório: Ana Moretti, Angélica, Carol, Daniela, Jéssyca, Júlia, Laura, Leonora, Luciana, Raquel, Renata, Phelipe, Thais, Thalita, Vanda, Victor. substantially from in vitro studies using purified PDI and chimeras. In these experimental scenarios, PDI reductase and chaperone are readily approachable.
LISTA DE ABREVIATURASHowever, isomerase activity, the hallmark of PDI family, is significantly complex.Assessment of PDI roles in cells and tissues mainly relies on gain-or loss-of-function experiments. However, there is limited information regarding correlation of these results with PDI activities. In this manuscript, we put together the main methods described for measuring the four PDI activities: thiol reductase, thiol oxidase, thiol isomerase and chaperone, with emphasis on controls and critical interferents, such as detergentcontaining buffers. We also discuss the transposition of these methods from purified PDI to cellular or in vivo samples, with critical thoughts about the interpretation of results.Keywords: Protein disulfide isomerase, Chaperone, Isomerization, Oxidation.
INTRODUÇÃO
Estrutura da Dissulfeto Isomerase ProteicaA Dissulfeto Isomerase Proteíca -PDI (também denominada PDIA1 ou no genoma humano, gene P4HB) é uma chaperona redox pertencente ao grupo de ditiol-proteínas da superfamília da tiorredoxina ( Fig. 1 A PDI é uma proteína de 55 kDa formada por quatro domínios tiorredoxina (denominados a-b-b'-a '), sendo que os sítios catalíticos contém 2 cisteínas (motivo WCGHC) e estão presentes nos dois domínios a e a' (Fig. 1 Estudos de cristalização da PDI de levedura realizados em diferentes temperaturas (4°C versus 22°) (Tian e col., 2006; Tian e col., 2008) descreveram uma proteína altamente flexível, que pode portanto, ajustar sua estrutura para ligar substratos de diferentes tamanhos e conformações, de tal forma que permite a acessibilidade dos sítios redox da PDI para tióis críticos dos substratos. Nestes trabalhos observou-se que a PDI de levedura pode apresentar duas distintas conformações, dependendo da temperatura de cristalização: i) uma forma em "U", na qual os dois sítios catalíticos estão frente a frente e os resíduos hidrofóbicos estão na base rígida do "U" (Fig. 3) ou ii) uma forma aberta, denominada "forma de barco". Além disso, ...