No-Antibiotic-Pectin-Based Treatment Differently Modified Cloaca Bacteriobiome of Male and Female Broiler Chickens

Abstract

As the information about the effect of pectin prebiotics on chicken gut microbiota is scarce, by using high throughput metagenomic sequencing with Illumina Miseq we examined the cloaca bacteriobiome of male and female chickens receiving antibiotic- or pectin-containing drinking water. The bacteriobiome was dominated by two phyla (Firmicutes and Proteobacteria) and three classes (Clostridia, Bacilli and Gammaproteobacteria), with the difference displayed by the relative abundance of 42 OTUs. At the level of the major dominant OTUs, prebiotic supplementation drastically increased Enterococcus abundance (from 0 to 11% and 23% in males and females, respectively). The better feed use efficiency and growth performance of the pectin-receiving chickens implied their better health and corroborated putative beneficial role of the altered bacteriobiome, although its ecophysiological and/or pathogenic importance could not be readily inferred. Notably, the gut microbiota response to antibiotics showed more sex-related differential OTUs as compared to the pectin prebiotic (19 vs. 4), suggesting different mechanisms of the studied supplementations in shaping the gut bacteriobiome in different sexes. Therefore, we recommend targeting sex as a separate factor in interventional studies to account for sex-specific peculiarities in the microbiome response and taking into account the male/female ratio of industrial flocks prior to choosing a production technology. The studied prebiotic (pectin) can be used in developing new pre/symbiotic preparations and supplementation regimes as alternatives to antibiotics for stimulating broiler chicken production.

Comparing western (Megascops kennicottii) and whiskered (M. trichopsis) screech-owl microbiomes in southern Arizona using a novel 16S rRNA sequencing method

“…This species, along with other species in the genus (specifically, B. producta and B. hominis), were also part of the core microbiomes identified. Most reports of B. hydrogenotrophica come from humans and ruminants, but several studies report this species in broiler chickens [40,41], especially in context with potential probiotic properties [42]. This species is known to help the host digest plant material [42], which may point to these owls consuming herbivorous arthropods.…”

Analysis of pathogenetic manifestation of decompensated intestinal dysbacteriosis in cats

“…Клинический опыт показывает, что при воздействии комплекса неблагоприятных факторов внешней среды, неполноценного питания, нарушений ветеринарносанитарных норм содержания, несоблюдении профилактических карт вакцинации инфекционных болезней и эмпирической антибиотикотерапии может снижаться иммунореактивность организма, и, как следствие, может возникать ряд иммунодефицитных состояний [1][2][3][4]. В результате приведенного комплекса причин, а также на фоне снижения количества индигенной микробиоты в различных биотопах организма активизируется рост и развитие условно патогенной микрофлоры, могут появиться штаммы с патогенными свой ствами [2,[5][6][7][8][9].…”

“…Клинический опыт показывает, что при воздействии комплекса неблагоприятных факторов внешней среды, неполноценного питания, нарушений ветеринарносанитарных норм содержания, несоблюдении профилактических карт вакцинации инфекционных болезней и эмпирической антибиотикотерапии может снижаться иммунореактивность организма, и, как следствие, может возникать ряд иммунодефицитных состояний [1][2][3][4]. В результате приведенного комплекса причин, а также на фоне снижения количества индигенной микробиоты в различных биотопах организма активизируется рост и развитие условно патогенной микрофлоры, могут появиться штаммы с патогенными свой ствами [2,[5][6][7][8][9]. Изменение экологического баланса в микробиоценозе может изменить законы форматирования микроэкологических систем, что приводит к возможности роста и развития нестандартных сочетаний микроорганизмов в биотопах организма, которые приведут к возникновению новых сложнокомпонентных и, зачастую, недоброкачественных микробиоценозов [7,[10][11][12][13].…”

“…В последние десятилетия у мелких домашних животных регистрируется неуклонный рост патологий, сопровождающихся нарушениями работы желудочнокишечного тракта различной этиологии [9,15]. Однако несмотря на создание новых поколений антибактериальных препаратов, пробиотиков, фитобиотиков, пребиотиков, вследствие просчетов при своевременной постановке диагноза, частота возникновения дисбактериозов при различных патологических процессах не только не снижается, а, наоборот, постоянно растет [2,16,17]. Поэтому оптимизация и совершенствование диагностических подходов, а также предложение новых эффективных схем коррекции дисбактериоза кишечника наиболее тяжелой декомпенсированной степени у кошек, на наш взгляд, является актуальным направлением научных изысканий в ветеринарной гастроэнтерологии.…”

Effects of a multi-genus synbiotic on gut health, microbiome and performance in broiler breeders and their progeny

“…Among the most influenced were representatives of Lachnospiraceae, a family of cellulolytic bacteria capable of metabolizing non-starch polysaccharides that are among the earliest colonizers of the caecum of broiler chickens (Richards et al, 2019, Fisinin et al, 2016, which were overrepresented in synbiotic-fed flocks compared to control ones. On the other hand, ASVs belonging to the genera Faecalibacterium, which are common inhabitants of the caeca involved in butyrate production and in the anti-inflammatory response (Luo et al, 2013, Liu et al, 2021, and Monoglobus, a less abundant component of the intestinal microbiome capable of degrading pectin (Lysko et al, 2021), were underrepresented, along with others classifiable as Clostridia UCG-014. Overall, based on alpha diversity measures, PS chickens exhibited a lower species richness than control ones.…”