Diante dos desafios atuais da atualidade, ensinar Ciências para além de uma forma conteudista torna-se uma necessidade crescente. Nesse sentido, é fundamental envolver os estudantes no processo de Alfabetização Científica. No contexto da sala de aula, o Ensino de Ciências por Investigação (ENCI) é uma abordagem que propicia esse processo e favorece as interações em sala de aula, sobretudo ao fazer os estudantes desenvolverem práticas epistêmicas. No entanto, estudos ainda salientam a necessidade de aperfeiçoá-lo, sobretudo em relação a essas práticas. Por isso, este artigo tem como objetivo investigar, à luz da perspectiva bakhtiniana, as contribuições das práticas epistêmicas do ENCI à Alfabetização Científica dos estudantes dos Anos Iniciais do Ensino Fundamental. Para isso, foram realizadas videogravações de uma Sequência de Ensino Investigativo (SEI) com uma turma de 3º ano do Ensino Fundamental. Para analisar os dados, as aulas foram transcritas e selecionamos Episódios de Ensino. Além disso, utilizamos uma construção metodológica baseada no pensamento bakhtiniano. Como resultados, destacamos as relações que podem ser estabelecidas entre as interações, as práticas epistêmicas do ensino por Investigação e elementos da Alfabetização Científica, sendo que ambos ocorrem geralmente em concomitância. Além disso, salientamos a importância da orientação da professora durante a investigação para que os estudantes assumam o protagonismo das aulas e participem ativamente na construção do conhecimento. Portanto, é importante que haja continuidade de pesquisas que aprofundem essas relações e promovam investigações em sala de aula, visando a melhoria da qualidade do ensino de Ciências.