A zona portuária de Belém, situada no estuário Guajarino, abriga os portos de Belém, Terminal Petroquímico de Miramar e Porto de Outeiro. Neste sentido, este estudo buscou criar indicadores de qualidade da água, através da análise fatorial que reflitam as peculiaridades e a dinâmica da zona portuária de Belém. Foram feitas amostragens mensais de água ao longo dos anos de 2014 e 2016, em toda zona portuária, englobando os três. Os resultados foram submetidos a análise fatorial (AF) para criação do Indicador de Avaliação Padronizado (IAP), que classificou a qualidade das águas amostradas nas faixas péssima, ruim, regular, boa e ótima. Os resultados mostraram que 46,03% e 42,85% das amostras do porto de Belém ficaram classificadas como péssimas e ruins, respectivamente. O terminal de Miramar apresentou classificação péssima para 46,98% das amostras, e o porto de Belém concentrou 45,98% dessas amostras analisadas na faixa de qualidade ruim; por fim, o Porto de Outeiro também mostrou uma qualidade péssima para 52,58% das amostras. A AF possibilitou uma visão integrada dos dados, mostrando como os efeitos das atividades desenvolvidas ao longo da zona portuária de Belém influenciam a qualidade da água.