Os fungos desempenham funções que impactam a humanidade de diversas maneiras. Suas características metabólicas são importantes na biotecnologia, porém, tais microrganismos podem desencadear problemas de saúde pública de forma mais branda e até mesmo de modo letal. Objetivo: detectar a presença de fungos no acervo de uma biblioteca no município de São José do Rio Preto. Metodologia: foram coletadas quarenta amostras nas superfícies inanimadas das principais salas da biblioteca com o auxílio de swabs umedecidos em solução salina estéril, posteriormente encaminhados ao laboratório de biomedicina da Universidade Paulista – UNIP. As amostras foram semeadas em meio de cultura ágar Sabouraud Dextrose, tendo adicionado cloranfenicol. A técnica de microcultivo para a identificação dos fungos foi realizada de acordo com o Manual de Detecção e Identificação dos Fungos de Importância Médica da Agência Nacional de Vigilância Sanitária. Resultados: Houve positividade em trinta e uma amostras (78%) e em quatro delas, foi observado mais de um tipo de colônia (13%). Das vinte e duas superfícies de livros analisadas, foram isolados e identificados: Aspergillus flavus, Aspergillus niger, Cunninghamella sp., Cladosporium sp., Curvularia sp., Mucor sp. e Nigrospora sp. Nas oito superfícies de estantes: Aspergillus flavus, Aspergillus niger, Aspergillus versicolor, Penicillium sp. e Scopulariopsis sp. e, nos dez documentos: Aspergillus nidulans, Aspergillus sp., Cladosporium sp., Cunninghamella sp. e Trichoderma sp. Conclusão: Os fungos encontrados estão amplamente distribuídos no ambiente como solo e ar e, por diversos fatores, instalam-se em locais como bibliotecas. Em condições favoráveis, podem infectar o homem e causar perdas patrimoniais para os acervos.Palavras-chave: Acervo de biblioteca. Fungos filamentosos. Saúde pública.