Cochlospermum regium é uma planta medicinal nativa do Cerrado havendo poucos estudos químicos, agronômicos e biotecnológicos sobre esta espécie, a fim de se conhecer o potencial desta planta foram isolados cinquenta e três fungos endofíticos da folha e do caule. A identificação dos fungos endofíticos foi realizada utilizando-se a caracterização molecular com sequenciamento da região ITS. Foram identificados os fungos endofíticos Coloriopsis rígida (Cr-1), Diaporthe inconspícua (Cr-10), Phomopsis sp. (Cr-32), Nigrospora oryzae (Cr-41), Diaporthe pseudoinconspicua (Cr-44) e Asordaria conoidea (Cr-8). Todos os endófitos apresentaram atividade antagonista contra no mínimo um fitopatógeno de interesse agronômico (Fusarium oxysporum, Curvularia lunata e Bipolaris oryzae). No teste de alelopatia para compostos voláteis, utilizando sementes de alface, o fungo Cr-32 inibiu 100% da germinação das sementes no tempo 3. Já analisando o desenvolvimento das plântulas alguns fungos apresentaram inibição, Cr-16 com 40,80% de inibição no tempo 3, enquanto outros fungos estimularam o seu desenvolvimento, Cr-44 com 106,66% de estímulo no tempo 0. Após cultivo dos endófitos em meio PDB e obtenção dos extratos bruto AcOEt, foi confirmado a presença das classes flavonas, flavonóis, xantonas, esteroides e triterpenoides para todos os extratos, além de confirmar a atividade antioxidante frente ao DPPH também para todos os extratos.