Ramie BnALDH genes and their potential role involved in adaptation to hydroponic culturing condition

Chen, Jikang; Gao, Gang; Yu, Chang Yeon; Chen, Ping; Chen, Kunmei; Wang, Xiaofei; Bai, Lianyang; Zhu, Aiguo

doi:10.1016/j.indcrop.2020.112928

Cited by 6 publications

(2 citation statements)

References 54 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Ramie ( Boehmeria nivea L.) is a multipurpose crop, widely used as fiber, medicinal preparation, forage, phytoremediation, and as biofuel [ 1 ]. It has been cultivated in Asia for over 4000 years [ 2 ].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Genome-Wide Analysis of AP2/ERF Gene Superfamily in Ramie (Boehmeria nivea L.) Revealed Their Synergistic Roles in Regulating Abiotic Stress Resistance and Ramet Development

Qiu

Zhao

Abubakar

et al. 2022

IJMS

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

AP2/ERF transcription factors (TFs) are one of the largest superfamilies in plants, and play vital roles in growth and response to biotic/abiotic stresses. Although the AP2/ERF family has been extensively characterized in many species, very little is known about this family in ramie (Boehmeria nivea L.). In this study, 138 AP2/ERF TFs were identified from the ramie genome and were grouped into five subfamilies, including the AP2 (19), RAV (5), Soloist (1), ERF (77), and DREB (36). Unique motifs were found in the DREB/ERF subfamily members, implying significance to the AP2/ERF TF functions in these evolutionary branches. Segmental duplication events were found to play predominant roles in the BnAP2/ERF TF family expansion. Light-, stress-, and phytohormone-responsive elements were identified in the promoter region of BnAP2/ERF genes, with abscisic acid response elements (ABRE), methyl jasmonate response elements, and the dehydration response element (DRE) being dominant. The integrated transcriptome and quantitative real-time PCR (qPCR) revealed 12 key BnAP2/ERF genes positively responding to waterlogging. Five of the genes are also involved in ramet development, with two (BnERF-30 and BnERF-32) further showing multifunctional roles. The protein interaction prediction analysis further verified their crosstalk mechanism in coordinating waterlogging resistance and ramet development. Our study provides new insights into the presence of AP2/ERF TFs in ramie, and provides candidate AP2/ERF TFs for further studies on breeding varieties with coupling between water stress tolerance and high yield.

show abstract

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Genome-Wide Analysis of AP2/ERF Gene Superfamily in Ramie (Boehmeria nivea L.) Revealed Their Synergistic Roles in Regulating Abiotic Stress Resistance and Ramet Development

Qiu

Zhao

Abubakar

et al. 2022

IJMS

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…[11] juga melakukan penelitian budidaya tomat dengan hidroponik. Dengan hidroponik, tanaman juga terhindar dari penyakit bawaan tanah [12]. Walaupun teknik hidroponik memiliki banyak keuntungan, namun terdapat polutan WNS sebagai hasil dari cairan hidroponik.…”

Section: Pendahuluanunclassified

Pengontrol pH dan Nutrisi Tanaman Selada pada Hidroponik Sistem NFT Berbasis Arduino

Wati¹,

Sholihah²

2021

JURNAL MULTIMEDIA NETWORKING INFORMATICS

View full text Add to dashboard Cite

Metode yang digunakan sistem hidroponik di BBP2TP sebagai tempat edukasi serta pembelajaran mengenai pengkajian dan pengembangan teknologi pertanian masih manual. Hal tersebut dapat dilihat saat petugas melakukan pengecekan nilai pH dan nutrisi, dimana petugas harus mendatangi tempat instalasi hidroponik untuk mengukur nilai pH dan nutrisi ke dalam tandon air dengan menggunakan alat berupa pH meter dan TDS meter. Jika nilai pH dan nutrisi belum sesuai maka dilakukan penambahan cairan pH atau nutrisi ke dalam tandon air hingga nilai pH dan nutrisi sesuai dengan yang diinginkan. Teknologi Smart Farming memungkinkan suatu alat yang dapat mengukur dan melihat nilai pH dan nutrisi sistem hidroponik. Arduino yang dapat membuat sistem menjadi otomatis, Sensor pH berfungsi sebagai pengukuran pH, Sensor TDS sebagai alat mengukur nilai nutrisi dan LCD 20x4 digunakan utuk melihat nilai pH dan nutrisi. Sehingga ketika nilai pH dan nutrisi berkurang, secara otomatis arduino akan menjalan sensor pH atau TDS untuk menyalakan pompa pH atau nutrisi. Saat nilai pH dan nutrisi telah sesuai maka pompa pH dan nutrisi akan terhenti. Dengan adanya sistem ini maka perkerjaan petugas lebih efisienMetode yang digunakan sistem hidroponik di BBP2TP sebagai tempat edukasi serta pembelajaran mengenai pengkajian dan pengembangan teknologi pertanian masih manual. Hal tersebut dapat dilihat saat petugas melakukan pengecekan nilai pH dan nutrisi, dimana petugas harus mendatangi tempat instalasi hidroponik untuk mengukur nilai pH dan nutrisi ke dalam tandon air dengan menggunakan alat berupa pH meter dan TDS meter. Jika nilai pH dan nutrisi belum sesuai maka dilakukan penambahan cairan pH atau nutrisi ke dalam tandon air hingga nilai pH dan nutrisi sesuai dengan yang diinginkan. Teknologi Smart Farming memungkinkan suatu alat yang dapat mengukur dan melihat nilai pH dan nutrisi sistem hidroponik. Arduino yang dapat membuat sistem menjadi otomatis, Sensor pH berfungsi sebagai pengukuran pH, Sensor TDS sebagai alat mengukur nilai nutrisi dan LCD 20x4 digunakan utuk melihat nilai pH dan nutrisi. Sehingga ketika nilai pH dan nutrisi berkurang, secara otomatis arduino akan menjalan sensor pH atau TDS untuk menyalakan pompa pH atau nutrisi. Saat nilai pH dan nutrisi telah sesuai maka pompa pH dan nutrisi akan terhenti. Dengan adanya sistem ini maka perkerjaan petugas lebih efisien

show abstract

Characterization of underutilized root starches from eight varieties of ramie (Boehmeria nivea) grown in China

Ren

Wei

Chen

et al. 2021

International Journal of Biological Macromolecules

View full text Add to dashboard Cite

Ramie BnALDH genes and their potential role involved in adaptation to hydroponic culturing condition

Cited by 6 publications

References 54 publications

Genome-Wide Analysis of AP2/ERF Gene Superfamily in Ramie (Boehmeria nivea L.) Revealed Their Synergistic Roles in Regulating Abiotic Stress Resistance and Ramet Development

Genome-Wide Analysis of AP2/ERF Gene Superfamily in Ramie (Boehmeria nivea L.) Revealed Their Synergistic Roles in Regulating Abiotic Stress Resistance and Ramet Development

Pengontrol pH dan Nutrisi Tanaman Selada pada Hidroponik Sistem NFT Berbasis Arduino

Characterization of underutilized root starches from eight varieties of ramie (Boehmeria nivea) grown in China

Contact Info

Product

Resources

About