Regiões genômicas associadas a características de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens Brasileiras de galinha

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi caracterizar genotipicamente, e construir o mapa de ligação e mapear locos associados a características quantitativas (QTL) de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras galinhas. Utilizou-se uma população F 2 CTCT, resultante do acasalamento entre machos da linhagem de postura CC e fêmeas da linhagem de corte TT. Um total de 356 animais foi genotipado com 11 marcadores microssatélites. A caracterização genotípica foi realizada pela estimação dos seguintes parâmetros genotípicos: conteúdo de informação polimórfica (0,45-0,69), heterozigosidades observada (0,48-1,00) e esperada (0,48-0,74), e número de alelos por loco (3-5). Empregou-se o mapeamento por intervalo combinado à modelagem fenotípica por modelo misto, no mapeamento de QTL. O comprimento do mapa de ligação foi de 174,7 cM. Não foram constatadas inversões entre o mapa obtido, o mapa consenso e o genoma. Foram mapeados nove QTL, dos quais sete foram sugestivos ("log of odds", LOD≤1,5) e dois significativos ao nível cromossômico (LOD>3,0). Seis destes QTL são inéditos: conversão alimentar e eficiência alimentar dos 35 aos 41 dias de idade (significativo), pesos de cabeça e fígado, e triglicerídeos e triglicerídeos+colesterol. A população CTCT apresenta variabilidade genotípica, o mapa de ligação é similar ao mapa consenso e ao genoma, e novos QTL foram mapeados.Termos para indexação: avicultura, mapeamento por intervalo, marcadores microssatélites, locos de características quantitativas. Genomic regions associated with performance and carcass traits on chromosome 5 of Brazilian chicken linesAbstract -The objective of this work was to genotype, construct the linkage map and map quantitative trait loci (QTL) associated with performance and carcass on chromosome 5 of Brazilian chickens lines. It was used a F 2 CTCT chicken population, resulting from the crossing of males from a CC layer line with females from a TT broiler line. A total of 356 animals were genotyped with 11 microsatellite markers. Genotypic characterization was carried out by the estimation of the following genotypic parameters: polymorphic information content (0.45-0.69), observed (0.48-1.00) and expected (0.48-0.74) heterozygosities, and number of alleles per locus (3-5). QTL mapping used interval mapping combined with phenotypic modeling via mixed model. The length of the linkage map was 174.7 cM. No inversions were found between the obtained map, the consensus map, and the genome. Nine QTL were mapped, of which seven were suggestive (log of odds, LOD≤1.5) and two significant at the chromosome level (LOD>3.0). Six of these QTL are original: feed conversion and feed efficiency from 35 to 41 days of age (significative), weight of head and liver, and triglycerides and triglycerides+cholesterol. The CTCT population shows genotypic variability, the linkage map is similar to consensus map and genome, and new QTL were mapped.

Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 2 da galinha associado a deposição de músculo

“…Na TCTC QTL foram mapeados no cromossomo 1 (NONES et al, 2006), 2 e 4 (BARON et al, 2010), 3 e 5 (RUY et al, 2007), 6, 7, 8, 11 e 13 (MOURA et al, 2006BOSCHIERO, 2009), 19, 23, 24 e 26-28 (AMBO, 2007), 9, 10, 12, 14-18 (BARON et al, 2010NONES et al, 2012). Na população CTCT foram mapeados QTLs nos cromossomos 1, 3 e 4 (ROSÁRIO et al, 2009(ROSÁRIO et al, , 2010SILVA et al, 2011). SIEGEL; ASHWELL, 2011), porcentagem e peso de gordura abdominal (JENNEN et al, 2004;CAMPOS et al, 2009), produção e qualidade dos ovos (BHATTACHARYA et al, 2011;XU et al, 2011) entre outras.…”