The effect of extracellular matrix on the differentiation of mouse embryonic stem cells

Özdil, Berrin; Güler, Günnur; Açıkgöz, Eda; Kocatürk, Duygu Çalık; Aktuğ, Hüseyin

doi:10.1002/jcb.29159

Cited by 6 publications

(3 citation statements)

References 52 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…30 Enhancement of VEGF in future organotypic studies may help determine the arachnoid response to different stimuli. In this study the limited arachnoid saturation into deeper portions of the brain slice may be a consequence of competitive interactions with other neuroectodermal cells, 31 apoptosis, or environmental factors like limited oxygen availability 32,33 or gas exchange.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 92%

Effect of Parenchymal Arachnoid on Brain Fluid Transport

Hansen

Janson²,

Romanova³

et al. 2024

BCN

View full text Add to dashboard Cite

Introduction: The pia-arachnoid is a critical component of cerebrospinal fluid removal. It covers and invaginates into brain parenchyma and physiologic failure results in hydrocephalus and cerebral edema. The purpose of this study was to characterize the role of arachnoid within brain parenchyma and determine if water flux and solute transport is affected by these intra-parenchymal cells. Methods: An immortalized arachnoid rat cell line was used to seed 300 µm organotypic rat brain slices of 4-week old rats. Fluid and tracer transport analyses were conducted following a 7-10 day intraparenchymal growth period. The development of an arachnoid brain slice model was characterized using diffusion chamber experiments to calculate permeability, diffusion coefficient, and flux. Results: Labeled rat arachnoid cells readily penetrated organotypic cultures for up to 10 days. A significant reduction of dye and water flux across arachnoid impregnated brain slices was observed after 3 hours in the diffusion chamber. Permeability decreased in whole brain slices containing arachnoid cells compared to slices without arachnoid cells. While a significant reduction of dextran across all slices occurred when molecular weights increased from 40 kDA to 70kDA. Conclusion:Tracer and small molecule studies show that the presence of arachnoid cells have a significant impact on the movement of water through brain parenchyma. Size differential experiments indicate that between 40 and 70 kDa, the permeability of solute changed substantially, which is an important marker of blood-CSF barrier definition. We have developed an arachnoid organotypic model that reveals their ability to alter permeability and transport.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 92%

Effect of Parenchymal Arachnoid on Brain Fluid Transport

Hansen

Janson²,

Romanova³

et al. 2024

BCN

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Bir titreşim spektroskopisi olan Fourier dönüşümlü kızılötesi (FTIR) spektroskopisi moleküllerin fonksiyonel grupları ile molekül içi/moleküller arası bağlar hakkında doğrudan bilgi sağlamaktadır. IR spektroskopi doku, hücre ve diğer biyolojik örneklerin araştırmalarında yaygın olarak kullanılan biyofiziksel tekniklerden biridir (8)(9)(10)(11)(12)(13)(14)(15)(16). Bu çalışmamızda, MCF-7 meme kanser hücre hattındaki CD44+/CD24-yüzey belirteç özelliği gösteren MKKH"lerin akış sitometrisi ile izole edildikten sonra FTIR spektroskopisi ile hücre biyokimyasındaki farklılaşmalarının ortaya çıkarılması ve moleküler mekanizmanın aydınlatılması amaçlanmıştır.…”

Section: Uluslararasıunclassified

Investigation of breast cancer stem cells in vitro by using IR spectroscopy

et al. 2020

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Öz Amaç: Kanser kök hücreleri (KKH), tümör içinde kendi kendilerini yenileme ve diğer hücre tiplerine farklılaşabilme kapasitesi sebebiyle tümörün başlaması, ilerlemesi, nüksetmesi, metastaz ve terapötik dirence yol açmaktadır. Bu nedenle, meme kanser kök hücrelerinin (MKKH) karakteristik özelliklerinin belirlenmesi gerekmektedir. Bu çalışmanın amacı, MKKH"lerin akış sitometrisi ile izole edildikten sonra Fourier dönüşümlü kızılötesi (FTIR) spektroskopisi kullanarak hücre biyokimyasındaki farklılaşmalarının moleküler seviyede araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: MCF-7 meme kanser hücre hattındaki CD44+/CD24-yüzey belirteç özelliği gösteren MKKH"ler akış sitometrisi ile izole edilmiştir. MCF10A, MCF-7 kanser hücre (KH) hattı ve bu hattan izole edilen CD44+/CD24-yüzey belirteç özelliklerine sahip MKKH"'ler %0,9 NaCI içerisine resuspanse edildikten sonra FTIR spektrometre ile ölçülmüştür. Bulgular: MCF-7 içerisindeki CD44+/CD24-yüzey belirteç özelliğine sahip KKH"lerinin sort oranı %2,0-2,3 olarak belirlenmiştir. Elde edilen FTIR spektrumlarında, MKKH, meme kanser hücreleri (KH, non-KKH, bulk populasyon) ve sağlıklı hücreler arasında spektral benzerlikler ve farklılıklar tespit edilmiştir. MKKH"lerde lipit ve protein sinyalleri daha güçlü olup hücre zarı akışkanlığı ve dinamiği fazladır. Sağlıklı hücreler ile kıyaslandığında, KH"lerde α-helikal proteinler ve DNA sinyallerinde azalmaya karşın negatif yüklü karboksil gruplarından kaynaklanan sinyallerde artış gözlenmektedir. Bu veriler, MKKH"lerin, sağlıklı ve KH"lere kıyasla yapı, içerik ve dinamiği bakımından oldukça farklı bir profil sergilediğini göstermektedir. Sonuç: Bu çalışma, MKKH"lerinin moleküler yapısı ve içeriğindeki değişikliklerin incelemesi vasıtasıyla terapötik hedefli ilaç çalışmaları yapılabileceğini ortaya koymaktadır. FTIR spektroskopisi boyar madde gerektirmeden, hassas ve hızlı ölçüm alınması, örnek hazırlamada kolaylık ve az miktarda örnek gerektirmesi sebebiyle ileri hücre çalışmalarında ve medikal alanda biyolojik örneklerin analizlerinde kullanılabileceği de gösterilmiştir. Anahtar Sözcükler: Meme kanseri, kanser kök hücresi, FTIR spektroskopisi, hücre zarı akışkanlığı.

show abstract

“…In addition, a downregulation of osteogenic-associated genes and upstream signaling pathway genes has been observed [ 23 , 24 ]. The changes in ECM composition during osteogenic differentiation may alter the mechanical properties of the tissue and also affect certain signaling pathways involved in osteogenic commitment [ 25 , 26 , 27 ].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Simulated Microgravity Remodels Extracellular Matrix of Osteocommitted Mesenchymal Stromal Cells

Zhivodernikov

Ratushnyy

Буравкова

2021

IJMS

View full text Add to dashboard Cite

The extracellular matrix (ECM) is the principal structure of bone tissue. Long-term spaceflights lead to osteopenia, which may be a result of the changes in composition as well as remodeling of the ECM by osteogenic cells. To elucidate the cellular effects of microgravity, human mesenchymal stromal cells (MSCs) and their osteocommitted progeny were exposed to simulated microgravity (SMG) for 10 days using random positioning machine (RPM). After RPM exposure, an imbalance of MSC collagen/non-collagen ratio at the expense of a decreased level of collagenous proteins was detected. At the same time, the secretion of proteases (cathepsin A, cathepsin D, MMP3) was increased. No significant effects of SMG on the expression of stromal markers and cell adhesion molecules on the MSC surface were noted. Upregulation of COL11A1, CTNND1, TIMP3, and TNC and downregulation of HAS1, ITGA3, ITGB1, LAMA3, MMP1, and MMP11 were detected in RPM exposed MSCs. ECM-associated transcriptomic changes were more pronounced in osteocommitted progeny. Thus, 10 days of SMG provokes a decrease in the collagenous components of ECM, probably due to the decrease in collagen synthesis and activation of proteases. The presented data demonstrate that ECM-associated molecules of both native and osteocommitted MSCs may be involved in bone matrix reorganization during spaceflight.

show abstract

The effect of extracellular matrix on the differentiation of mouse embryonic stem cells

Cited by 6 publications

References 52 publications

Effect of Parenchymal Arachnoid on Brain Fluid Transport

Effect of Parenchymal Arachnoid on Brain Fluid Transport

Investigation of breast cancer stem cells in vitro by using IR spectroscopy

Simulated Microgravity Remodels Extracellular Matrix of Osteocommitted Mesenchymal Stromal Cells

Contact Info

Product

Resources

About