En algunos casos médicos, como cirugías y tratamiento de enfermedades cardiovasculares, o traumatismos es necesario el uso de la transfusión de sangre debido al riesgo o la presencia de hemorragia. Sin embargo, puede haber inconvenientes como la disponibilidad limitada de sangre, por falta de donantes, así como incompatibilidad de grupo sanguíneo o factor Rh, el riesgo de transmisión de enfermedades a través de la transfusión o el rechazo del procedimiento por parte del paciente. Por ello, se ha hecho necesario desarrollar sustancias denominadas hemosustituto, o hemoglobinas modificadas, que puedan sustituir a la sangre en su función de transporte de oxígeno. Uno de los fenómenos a evaluar para determinar la seguridad de los hemosustitutos, es el esfuerzo cortante sobre el endotelio. Tanto los esfuerzos elevados como muy bajos pueden generar daños en la función del endotelio produciendo arterias rígidas cuando se tiene un esfuerzo cortante elevado o el colapso de la arteria cuando el esfuerzo cortante disminuye o tiende a cero. Este fenómeno puede observarse mediante secuencias de imágenes de microscopía. En esta evaluación se requiere un grado importante de experticia, ya que los vasos capilares son muy pequeños y determinar la velocidad del flujo sanguíneo es difícil manualmente. Por ello, en este trabajo se propone una nueva técnica para la medición del flujo sanguíneo, desarrollada como un plugin para el programa imageJ. Emplea el canal de color con mayor entropía, sobre el que se realiza una detección de simetría y una transformación de producto de gradiente para la extracción del eje central y la estimación de la velocidad del flujo arteriolar hemostático. Los resultados fueron comparados con los obtenidos manualmente, presentando una mayor precisión y una estimación más rápida al permitir una mejor localización del punto por el que transita el hemosustituto en un tiempo determinado.