A educação do Brasil se depara com algumas dificuldades, e estas são refletidas nos resultados das avaliações internas e externas. Estes evidenciam as dificuldades que os alunos têm em aprender e compreender os conteúdos de química. O objetivo deste trabalho é realizar uma análise das dificuldades relatadas por alunos do 3º ano do Ensino Médio de uma escola pública regular, localizada no Pecém (município de São Gonçalo do Amarante – CE), em face dos conteúdos de Química abordados no Exame Nacional do Ensino Médio - ENEM. Este trabalho se caracteriza como uma pesquisa aplicada, de natureza quantitativa e caráter exploratório. Foi aplicado um questionário, com os conteúdos recorrentes no ENEM, com a finalidade de compreender em quais assuntos os alunos apresentaram mais dificuldades e a partir disto, fazer uma discussão dessas informações à luz dos teóricos ligados as principais tendências pedagógicas vigentes. Os resultados desta pesquisa demonstraram que os conteúdos que apresentaram o pior desempenho por parte dos estudantes foram: compostos orgânicos e cálculos estequiométricos, os quais necessitam de um conhecimento prévio de cálculos, além de interpretação para identificar as funções oxigenadas e entender sua nomenclatura.