V3 Loop region of the HIV-1 gpl20 envelope protein is essential for virus infectivity

Computer-Aided Design of Novel HIV-1 Entry Inhibitors Based on Glycosphingolipids

“…Известно [47][48][49][50][51][52][53], что основание V3-домена ВИЧ-1 взаимодействует с N'-концевым сегментом корецептора CCR5, а его верхушка -со второй внеклеточной петлей EСL2 этой молекулы. В первом случае ключевую роль в связывании белка gp120 с корецептором CCR5 играет остаток Arg-3 петли V3 [38,39] а во втором -аминокислоты, расположенные на ее консервативном сегменте Gly15-Pro16-Gly17 [54][55][56][57]. Замена Pro16 на аланин вызывает изменения инфективности и иммуногенности ВИЧ-1 [54,55], а одиночные замены остатков Gly15, Gly17 или соседнего с ними Arg18 могут быть летальными для инфективности вируса и его способности к образованию синцитиев [56,57].…”

“…В первом случае ключевую роль в связывании белка gp120 с корецептором CCR5 играет остаток Arg-3 петли V3 [38,39] а во втором -аминокислоты, расположенные на ее консервативном сегменте Gly15-Pro16-Gly17 [54][55][56][57]. Замена Pro16 на аланин вызывает изменения инфективности и иммуногенности ВИЧ-1 [54,55], а одиночные замены остатков Gly15, Gly17 или соседнего с ними Arg18 могут быть летальными для инфективности вируса и его способности к образованию синцитиев [56,57]. Эти результаты подтверждают эксперименты с мутантными формами вируса, лишенными триплета Gly-Pro-Gly петли V3 белка gp120 [57].…”

Conformational rearrangements required of the V3 loop of HIV‐1 gp120 for proteolytic cleavage and infection

“…This conservation may be due to a requirement to maintain an essential /I-strand-turn-strand structural motif. Additionally, point mutations at G312, G314 or R315 produce non-infectious virions [15].…”

“…Additionally, Gotoh et al have shown that factor Xa from chick embryo is a critical determinant in paramyxovirus activation in chick embryos [13,14]. Mutations at G312, G314 or R315 produce non-infectious virions, thus highlighting the importance of this region, although the P313 to A313 mutation did not prevent infection [15]. Secondary structure analysis [ 121, solution NMR [16], and X-ray crystallographic studies [17] suggest that this sequence, immediately preceding the thrombin cleavage site, forms a type II /?-turn, with Pro313 at the i + 1 position, and with the adjacent segments forming antiparallel p-strands [12,16].…”

How can Improve DNA Vaccine Modalities as a Therapeutic Approach against HIV Infections?

“…The studies indicated that DNA vaccines expressing the MPER of HIV-1 gp41 induce different antibodies depending on their transmembrane and cytoplasmic domains [16]. In addition, neutralizing antibodies, which recognize the main neutralizing determinants of the gp120 Env protein (e.g., the V3 loop region), have been shown to effectively block cell fusion and virus infectivity independent of the initial gp120-CD4 binding [17]. Thus, this region can broadly develop NAbs in HIV DNA vaccine design.…”