Variabilidade genética do umbuzeiro no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição da variabilidade genética do umbuzeiro (Spondias tuberosa), no Semi-Árido brasileiro, por meio de marcadores AFLP, para subsidiar estratégias de prospecção e conservação da espécie. Foram analisados 68 indivíduos de umbuzeiro de 15 ecorregiões, pelo dendrograma UPGMA e pela dispersão em escala multidimensional (MDS), com o coefi ciente de Jaccard de 141 bandas polimórfi cas de AFLP. A análise da variância molecular foi realizada pela decomposição total entre e dentro das regiões ecogeográfi cas. O dendrograma apresentou valor cofenético de 0,96, e o gráfi co MDS apresentou 0,25 para a falta de ajustamento. A variabilidade genética do umbuzeiro foi estimada em 0,3138, o que indica grande variação entre os grupos de indivíduos. Agrupamentos específi cos foram observados em seis regiões ecogeográfi cas, enquanto nas demais regiões observaram-se pares entre alguns indivíduos, sem formação de agrupamentos específi cos por local de amostragem, o que indica que a variabilidade genética do umbuzeiro não está uniformemente distribuída no Semi-Árido. Sugerem-se estratégias para o estabelecimento de maior número de áreas para conservação in situ ou amostragens de menor número de indivíduos, em várias unidades de paisagens, para conservação ex situ da variabilidade genética do umbuzeiro.Termos para indexação: Spondias tuberosa, análise multivariada, análise de variância molecular, dendrograma, escala multidimensional. Genetic variability of umbu trees in Brazilian Semi-Arid region, based on AFLP markersAbstract -The objective of this work was to evaluate the genetic variability distribution of umbu tree (Spondias tuberosa), within Brazilian Semi-Arid region, based on AFLP markers, in order to suggest prospecting and preservation strategies for this species. Sixty-eight umbu trees of 15 ecogeographic regions were analyzed for 141 polymorphic AFLP bands, through the UPGMA dendrogram and the multidimensional scaling (MDS), based on Jaccard's coeffi cient . Analysis of molecular variance was accomplished by total decomposition among and within ecogeographic regions. The dendrogram presented co-phenetic value of 0.96, while the MDS presented 0.25 for the badness-of-fi t. Umbu genetic variability was estimated in 0.3138, indicating a large variance among individual groups. Specifi c clusters were observed in six ecogeographic regions, and some individual pairs were observed in the other regions, with no specifi c clustering by sampling place, which indicates that the genetic variability of umbu tree is not uniformly distributed within Brazilian Semi-Arid. Strategies are suggested to set a larger number of protection areas for in situ conservation, or a smaller number of umbu individuals sampled, in various ecoregion units, for ex situ genetic variability conservation of this species.

Genetic similarity of Jatropha curcas accessions based on AFLP markers

“…The PCs produced the following numbers of polymorphic bands: ACT/CAT (13), AAG/CAT (9), AGC/CAC (12), AAG/CTC (12), ACA/CAT (14), AGG/ CTC (7), ACC/CTC (10), ACC/CCC (9), ACT/CTG (10), AAC/CTC (8), AGG/CAT (7), AAG/CAA (13), ACA/CTC (10), AAG/CTA (6), ACA/CCC (5), ACT/CAA (9), and AAC/ CTT (10). The mean of 9.6 differents polymorphic markers/ PC was lower than that reported by Vos et al (1995) and close to the mean of 10 polymorphic AFLP fragments reported by Santos et al (2008), who used silver-nitrate staining for umbu tree, under the same experimental conditions. Means of 1.4 and 7 monomorphic and polymorphic AFLP bands, respectively, were reported by Sun et al (2008), who used silver-nitrate staining, in J. curcas accessions in China.…”

Genetic characterization of fig tree mutants with molecular markers

“…Santos et al (2008), analyzing the genetic variability of the umbu fruit tree in a semi-arid area of Brazil, with an average of 14.2 bands per primer combination, obtained 141 and 58 polymorphic and monomorphic bands, respectively, using AFLP and 14 combinations of EcoR1/Mse1 primers (IC). A study of genetic diversity among sweet orange and Murcott tangor hybrids showed that of the 64 oligonucleotide primers used for fAFLP analysis, only 59 led to amplification results considered to provide enough resolution, originating 416 bands (Bastianel et al, 2006).…”

Análise biométrica de frutos de umbuzeiro do semiárido brasileiro

“…Características como maior tamanho de fruto, maior rendimento de polpa, redução do tamanho do caroço, dentre outras, são desejadas no melhoramento e é verificada grande variabilidade para esses caracteres (SANTOS, 1997;COSTA, et al, 2004;DUQUE, 2004;SANTOS et al, 2008). Assim, o objetivo desse trabalho foi caracterizar a variabilidade fenotípica existente entre os acessos de umbuzeiro, com base em dados quantitativos de frutos, visando aproveitá-la em futuro programa de melhoramento da espécie.…”