Os ecossistemas de manguezais são representados principalmente por formações vegetais litorâneas singulares morfo-fisiologicamente que possuem distintas fisionomias, desde herbáceas até arbóreas, e se localizam principalmente em deltas, lagunas ou estuários. Atualmente, são reconhecidos inúmeros bens e serviços prestados por estes ecossistemas que, no entanto, estão entre os mais ameaçados do mundo. Este artigo fornece uma síntese sobre o que se sabe a respeito dos manguezais e marismas da Baía Babitonga, no nordeste de Santa Catarina. Para isso, foi realizado um levantamento bibliográfico utilizando várias bases de dados eletrônicas e fontes de dados da literatura cinzenta. Destacou-se assuntos pertinentes como a composição florística e estrutural, a produtividade, a biologia das espécies e sua vulnerabilidade, os impactos antrópicos e os estudos realizados e em andamento sobre os manguezais e marismas da Baía da Babitonga.