Συγκριτική Μελέτη Εκκρινόμενων Πρωτεϊνών Από Μια Φυσιολογική Και Καρκινικές Κυτταρικές Σειρές Του Τραχήλου Της Μήτρας Για Την Ανάδειξη Καρκινικών Βιοδεικτών

Abstract

Κατά την καρκινογένεση, τα καρκινικά κύτταρα παράγουν εκκριτώματα με διαφορετικά ποιοτικά και ποσοτικά χαρακτηριστικά. Σκοπός της εργασίας ήταν η ανακάλυψη βιολογικών διαδικασιών που εμπλέκονται στην καρκινογένεση του τραχήλου της μήτρας, και πιθανών βιοδεικτών με την πρωτεωμική ανάλυση τεσσάρων αντιπροσωπευτικών κυτταρικών σειρών του τραχήλου της μήτρας: τη SiHa (HPV16+), τη HeLa (HPV18+), τη C33A (HPV-), και την HCK1T (φυσιολογική). Xρησιμοποιήθηκαν 2 πρωτεωμικές προσεγγίσεις για την επίτευξη του παραπάνω στόχου 1) Δισδιάστατη ηλεκτροφόρηση συζευγμένη με φασματομετρία μάζας (2DE-MALDI TOF-MS) και 2) Υγρή χρωματογραφία συζευγμένη με φασματομετρία μάζας (LC-MS/MS). Η πρωτεωμική ανάλυση απέδωσε νέες πληροφορίες (πρωτεΐνες-στόχοι) για τον μοριακό χαρακτηρισμό του καρκίνου του τραχήλου της μήτρας (π.χ beta ig-h3, PRDX2, SOD2, FUCA1, ADAM10, CATD). Ακολούθησε μια ολοκληρωμένη βιοπληροφορική ανάλυση και για τις 2 μεθοδολογίες η οποία απέδωσε απορρυθμισμένα βιολογικά μονοπάτια (π.χ. «Επαγωγή αντιοξειδωτικών πρωτεϊνών μέσω του μεταγραφικού παράγοντα NRF2» και «Καταστολή μεταλλοπρωτεϊνασών»). Τα αποτελέσματα της βιοπληροφορικής ανάλυσης καθώς και περαιτέρω πρωτεΐνες-στόχοι επιβεβαιώθηκαν με ανοσολογικές, ενζυμικές μεθόδους καθώς και τη μέθοδο υψηλής ευαισθησίας MRM (πχ ΤΙΜP1, CATD κτλ). Συμπερασματικά, αναγνωρίστηκαν εκκρινόμενες πρωτεΐνες οι οποίες μπορεί να είναι πιθανοί βιοδείκτες ή θεραπευτικοί στόχοι.