Background Triple therapy efficacy against Helicobacter pylori is low worldwide, and thus, alternatives must be sought to improve eradication. The aim of the present study was to determine CYP2C19 genetic polymorphism effect on H pylori eradication. Methods A randomized, single‐blinded clinical trial including 133 participants was carried out. H pylori infection was confirmed by histologic and microbiologic test. Antibiotic susceptibility to amoxicillin and clarithromycin was performed. CYP2C19 polymorphisms *1, *2, and *3 were analyzed by real‐time PCR (Roche ®), and nested PCR for CYP2C19*17 polymorphisms. Participants were randomized into two groups for different H pylori therapies, one with standard omeprazole doses and another with omeprazole doses depending on CYP2C19 polymorphism. H pylori eradication was verified by stool antigen tests (Meridian ®). Results The most common CYP2C19 polymorphism was *1/*1 in 54.9% of the participants followed by *17/*17 in 21.1%. Triple therapy efficacy with standard omeprazole doses versus personalized therapy based on CYP2C19 polymorphism by ITT analysis was 84% (95% CI: 0.73‐0.91) vs 92.2% (95% CI: 0.82‐0.97) (P = 0. 14), respectively. The efficacy by PP analysis was 92.1% (95% CI: 0.82‐0.97) vs 100% (95% CI: 0.92‐0.01) (P = 0.027), respectively. Conclusions The most frequent polymorphism was extensive PPI metabolizers (62.4%). Effectiveness of guided therapies by susceptibility test was good, yet they can be further improved by customized therapy based on CYP genotype. Therefore, high PPI (80 mg/d) doses are recommended for H pylori eradication therapies in Colombia. ClinicalTrials.gov ID: NCT03650543.

The aim of this work was to determine current cagA gene EPIYA motifs present in Colombian Helicobacter pylori isolates using a fast and reliable molecular test. DNA from eightyfive Helicobacter pylori-cagA positive strains were analyzed. Strains were obtained from patients diagnosed with functional dyspepsia at Clínica Fundadores in Bogotá. The 3' region of the cagA gene was amplified through conventional Polymerase Chain Reaction (PCR). Obtained amplicons were sequenced using the Sanger method and analyzed with bioinformatics tools. Additionally, a significant Spearman correlation coefficient was determined between the patients' age and the number of EPIYA-C repeats; with p values < 0.05 considered significant. Estimates were obtained using a 95% CI. The 3´variable region of the cagA gene was amplified and PCR products of the following sizes corresponded to the following EPIYA motifs: 400 bp: EPIYA AB, 500 bp: EPIYA ABC, 600 bp: EPIYA ABCC and 700 bp: ABCCC. A single PCR band was observed for 58 out of 85 Helicobacter pylori isolates, with an EPIYA distribution motif as follows: 7/85 AB (8.2%), 34/85 ABC (40%), 26/85 ABCC (30.6%) and 18/85 ABCCC (21.2%). However, in 27 out of 85 Helicobacter pylori isolates, two or more bands were observed, where the most predominant cagA genotype were ABC-ABCC (26%, 7/27) and ABCC-ABCCC (22.2%, 6/27). A direct proportionality between the number of EPIYA-C repeats and an increase in the patients' age was observed, finding a greater number of EPIYA ABCC and ABCCC repeats in the population over 50 years old. All isolates were of the Western cagA type and 51.8% of them were found to have multiple EPIYA-C repeats. These standardized molecular test allowed to identify the number of EPIYA C motifs based on band size.

El Helicobacter pylori (H. pylori) infecta por lo menos a la mitad de la población mundial, aunque la prevalen- cia es más alta en países subdesarrollados. La tasa de reinfección es variable en las diferentes regiones y puede incluir recrudescencia de la infección o verdadera recurrencia. Hasta el momento hay pocos estudios en Colombia que hayan investigado la recurrencia de la infección y ninguno se ha realizado en Bogotá, Colombia. Objetivo: determinar la tasa de recurrencia de H. pylori en pacientes tratados eficazmente con 3 terapias triples diferentes. Materiales y métodos: estudio observacional analítico anidado en una cohorte de 180 pacientes a la que se le erradicó exitosamente H. pylori durante 2008-2009. La erradicación se verificó con test respiratorio con urea marcada y el tiempo promedio de seguimiento fue 43,7 meses (rango 31-56 meses). La recurrencia se investigó con la prueba de antígenos fecales monoclonales ImmunoCard STAT® HpSA (Meridian Bioscience Inc.). Resultados: se siguieron 86 pacientes y el porcentaje total de reinfección por H. pylori fue de 5,8% (5/86) y la tasa anual de reinfección fue de 1,59% (5/313,4 pacientes año x 100). El primer caso de reinfección se presentó a los 32 meses y los demás ocurrieron a los 37, 42, 44 y 56 meses de seguimiento. La tasa de reinfección calculada fue 1,8%/año después de 2 años de seguimiento. Conclusiones: la tasa de reinfección de H. pylori en Bogotá es baja e inferior a la previamente informada para otras regiones de Colombia.

No abstract

Helicobacter pylori (H. pylori) es uno de los principales patógenos con el cual la humanidad, ha mantenido una estrecha relación desde hace aproximadamente 58000 años, mucho antes de que se iniciaran las migraciones humanas desde el África oriental, con las cuales este microorganismo fue diseminado hacia otras regiones del mundo (Falush et al., 2003). H. pylori afecta a cerca de dos tercios de la población mundial y su prevalencia está fuertemente relacionada con las condiciones socioeconómicas (Goodwin et al., 1985). (Malaty, 2007). En países en vía de desarrollo afecta a más de 80% de los adultos, en contraste con 20 a 50% en países desarrollados (Suerbaum y Michetti, 2002). En Colombia más del 80% de las personas mayores de 30 años están infectadas por H. pylori (Sierra et al., 1990) y por lo menos el 50% de los niños a la edad de 10 años (Rincón et al., 1999). Se adquiere en la infancia y si no se elimina con antimicrobianos, persiste durante la vida del individuo (Saad y Chey, 2005). En todos los infectados produce gastritis crónica, pero solo el 20% de ellos tendrá alguna enfermedad clínica. Del 10 a 20% de los infectados durante su vida tendrán riesgo de desarrollar úlceras pépticas y 1-3% de tener cáncer gástrico (Parsonnet, 1998). Un porcentaje menor (1%) podrá presentar dispepsia y 1/100.000 linfomas MALT. Teniendo en cuenta la probabilidad de desencadenar una enfermedad clínica en por lo menos el 20% de los infectados, se considera que la infección debe ser tratada con antimicrobianos, cada vez que sea diagnosticada (Rimbara et al., 2011).