A resposta de estresse pode ser definida como uma experiência de desconforto emocional, acompanhada por mudanças bioquímicas, fisiológicas e comportamentais. As alterações fisiológicas desencadeadas pelo estresse no organismo humano podem proporcionar distúrbios psicológicos e cognitivos no indivíduo, o que afeta diretamente sua qualidade de vida e, no caso dos estudantes, o aprendizado. Dessa forma, o estresse crônico é uma condição que representa uma barreira para o bem-estar e educação do estudante de Medicina, principalmente durante os ciclos de estágios realizados no internato. Objetivo: Avaliar o índice de estresse percebido dos alunos do quinto e sexto ano do curso de Medicina, em cada um dos ciclos de estágio do internato. Materiais e Métodos: O estudo é descritivo transversal com abordagem quantitativa. A Escala de Percepção de Estresse -10 (EPS-10) foi o instrumento utilizado para coleta de dados, e foi aplicada durante os diferentes ciclos de estágio durante o segundo semestre de 2020 e o primeiro semestre de 2021. Resultados: Obteve-se maior percepção de estresse por parte dos alunos no ciclo de Pediatria, quando comparado com os ciclos de Saúde Coletiva e Multidisciplinar. O mesmo ocorreu com o ciclo de Ginecologia e Obstetrícia, quando comparado com os mesmos dois ciclos. Conclusão: Nossos resultados sugerem diferenças no estresse percebido dos alunos durante os diferentes ciclos de estágio, apesar destas diferenças não terem sido identificadas para todas as áreas.