This study was conducted to isolate and identify three isolates of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), infecting tomato, using polymerase chain reaction technology (PCR) and determining the nucleotide sequences produced by PCR- amplified products to determine the genetic similarity and differences amongst the virus isolates. It also aimed to analyze the plant content of mineral elements: magnesium, calcium, sodium, and potassium to determine the effect of the virus on the plant content of these elements. The laboratory experiments mentioned in this study were carried out in the Plant Virology Laboratory of the Plant Protection Department at the College of Agriculture/ Karbala University. Analysis of the mineral elements was carried out in the Soil Laboratory, College of Agriculture/ University of Kufa. A greenhouse experiment was also carried out to investigate the response of some tomato genotypes against TYLCV during the agricultural season 2018-2019. Results of PCR amplification by the CP-F and CP-R primer pair revealed the possibility of amplifying a 789bp product from each TYLCV isolate isolated from some farms located in some desert areas in Najaf and Karbala governorates. Analysis of the sequences resulting from the PCR-amplified products obtained from the viral isolates (5, 8, and 10) by BLAST Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) indicated that all these viral isolates diagnosed in this study belong to TYLCV. TYLCV isolates 5 and 8 obtained from Najaf province had a 100% similarity in the sequences of PCR-amplified products amplified from the TYLCV coat protein. These isolates gave a difference (96%) in the coat protein nucleotide sequence of the virus isolate 10. Furthermore, analysis of some mineral elements in plants infected with TYLCV showed a decrease in the concentrations of magnesium and calcium and an increase in the concentrations of elements sodium and potassium with a significant difference from their normal concentrations in the non-infected plants.
أجريت هذه الدراسة في محافظة القادسية/ العراق عام 2016 لغرض السيطرة على مرض ذبول السمسم المتسبب عن الفطر الممرض Fusarium solani باستخدام كالسماد العضوي وفطر المكافحة الاحيائية Trichoderma harzianum و استخدام السماد الكيميائي N.P.K والمبيد الفطري Beltanol للمقارنة. أظهرت النتائج وجود قدرة تضادية عالية للفطرharzianum T. ضد الفطر الممرض F. solani بلغت 1.7 . اما المعاملة بالسماد العضوي فأنها ثبطت الفطر الممرض F. solani بنسبة 66.66% و حفزت نمو فطر المكافحة الحيوية T. harzianum بنسبة 27.71% مقارنة بمعاملة المقارنة التي بلغت 0.00%، تلتها معاملة السماد الكيميائي N.P.K التي ثبطت الفطر الممرض بنسبة 61.11% , في حين حفزت نمو فطر المكافحة الاحيائية بنسبة 21.05% مقارنة بمعاملة المقارنة التي بلغت 0.00%. أما المعاملة بالمبيد الفطري Beltanol فكان لها تأثير تثبيطي عالي على النمو الشعاعي للفطر الممرض بلغت 100%, في حين لم يثبط فطر المكافحة الاحيائي عند التركيز 1 مل/ لتر نستنتج من ذلك إن إضافة السماد العضوي والفطر T. harzianum قد وفر حماية عالية للبذور و البادرات والنباتات من تأثير الفطر الممرض F. solani, مع زيادة لمؤشرات نمو و حاصل نباتات السمسم.
This study aimed to determine the effect of some filtrate of bio-fungi (Trichoderma harzianum, T. asperelloides, Beauveria bassiana and Penicillium sp.) in controlling the two-spot spider mite that infects eggplant. Fungi filtrates have been tested against all roles of the red mite (eggs, larvae, nymphs and adults). The results showed that T. harzianum was the most effective among other fungi in controlling T. urticae, recording the lowest egg hatching of 55.42% and the highest mortality rate for motile instars, which reached 69.37 60.04 and 62.33 for larvae, nymphs and adults, respectively, with a significant difference from the fungi. T. asperelloides, B. bassiana, and Penicillium sp. respectively. As for the concentration of the filtrate, in general, the efficiency of the filtrate increased with increasing concentration. The concentration of 100% recorded the highest reduction in the number of hatched eggs with a hatching rate of 59.33% and an increase of the dead individuals with mortality rates of 60.00, 55.37 and 51.58% for larvae, nymphs and adults, respectively, compared to concentration 25%, which led to a hatching rate of 79.67% and significantly less mortality for all stages.
ﻨﻔﺫﺕ ﻫﺫﻩ الدراسة بهدف عزل و تشخيص ثلاث عزلات تابعة للفطر Pythium aphanidermatum المسبب لمرض تعفن بذور و موت بادرات الخيار (Cucumis sativus L.) جمعت من مناطق العباسية و أم عباسيات و القزوينية في محافظة النجف. أظهرت نتائج اختبار القدرة الامراضية لهذه العزلات الفطر P. aphanidermatum على بذور نبات الخيار ان جميع العزلات ادت الى زيادة تعفن البذور و كان أكثرها تأثيرا هي عزلة P. aphanidermatum المعزولة من منطقة العباسية, تلتها العزلة P. aphanidermatum المعزولة من منطقة أم عباسيات و من ثم العزلة المعزولة من منطقة القزوينية و بنسب تعفن بذور بلغت 90 و 74 و 72 %, على التوالي قياسا مع معاملة المقارنة التي بلغت فيها نسبة التعفن 0 %. كما اثبتت نتائج اختبار تفاعل البلمرة المتسلسل (Polymerase chain reaction, PCR) لعزلتي الفطر P. aphanidermatum الاولى و الثانية و التي كانت الاكثر امراضية لبذور نبات الخيار, امكانية مضاعفة نواتج من الحامض النووي (PCR-amplified products) بأحجام تراوحت بين 700-800 زوج قاعدة نايتروجينية (Base pairs, bp). اظهرت نتائج تحليل التتابع النيوكلوتيدي (Nucleotide sequence analysis) لنواتج الحوامض النووية المضاعفة من العزلات الفطرية و باستخدام برنامج BLAST بأن عزلتي الفطر المعزول تعود الى الفطر P. aphanidermatum. كما اظهرت احدى العزلات نسبة تشابه بلغت 100% مع العزلات المعزولة عالميا و المثبتة في المركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية (National Center for Biotechnology Information, NCBI). وجد من خلال استخدام برنامج BLAST ان عزلة الفطر P. aphanidermatum المعزولة من منطقة العباسية في محافظة النجف ذات نسبة تشابه وراثي تراوحت بين 99-98 %, مما يثبت بأن هذه العزلة هي عزلة جديدة غير مذكورة سابقا في قاعدة البيانات العائدة للمركز الوطني لمعلومات التقنية الحيوية (NCBI), لذا تم تسجيلها و ايداعها في المركز المذكور تحت رقم الادخال (GenBank Accession No.) MF347709.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.