O estudo busca analisar como os mecanismos de Governança Corporativa e a Teoria da Agência podem auxiliar os gestores no gerenciamento de conflitos de modo a minimizar prejuízos a gestão de uma cooperativa médica localizada na região noroeste do Estado do Rio Grande do Sul. Propõem-se um modelo teórico de hipóteses baseadas na literatura que foi analisado e validado com modelagem de equações estruturais PLS-SEM. A coleta de dados baseou-se em survey estruturada com 70 respondentes de diferentes níveis hierárquicos da cooperativa. Os resultados apontam que o desenvolvimento da Governança Corporativa e o entendimento e aplicação da Teoria da Agência influência positivamente o Gerenciamento de conflitos da cooperativa analisada.

No Brasil o terceiro setor surgiu enquanto alternativa para a crise do Estado de Bem-Estar Social e se consolidou, em parte, como um grande aliado na concretização das garantias sociais definidas na Constituição da República Federativa do Brasil de 1988. Em que pese os avanços nas áreas da educação, assistência social e saúde, ao serem convertidas às diretrizes governamentais, muitas das organizações não lucrativas, pré-existentes à redemocratização do país da década de 1980, distanciaram-se das bases comunitárias autônomas, fragilizando a ampliação dos espaços públicos de discussão e avaliação do papel do Estado. Este estudo foi desenvolvido com o propósito de contribuir com a discussão em questão, apresentando-se, ao mesmo tempo, proposições teóricas epistemológicas questionadoras da experiência brasileira, bem como, sugestões de linhas investigativas delas decorrentes, sobretudo diante da formulação das políticas públicas nacionais, cuja implementação depende, em decorrência da infraestrutura disponível, da complementação exercida pelas organizações sem fins lucrativos.  Palavras-chave: Terceiro setor. Filantropia. Garantias sociais.