Introducción: El cáncer en el año 2020 provoco 1,4 millones de muertes, el 47% en personas menores de 65 años de edad, la neutropenia febril en el paciente oncológico aumenta los casos de infecciones graves, incrementando la morbimortalidad cuando no se ha empezado un tratamiento de oportuno. El objetivo del presente estudio fue describir una población con esta patología en un centro de referencia regional. Metodología: Este estudio transversal, se realizó en el Instituto Oncológico Nacional “Dr. Juan Tanca Marengo”, Sociedad de Lucha contra el Cáncer, Solca-Guayaquil, período enero 2020- junio 2021, con una muestra no probabilística, de pacientes con neoplasias, neutropenias y cultivos positivos. Se registraron variables demográficas, clínicas, de laboratorio. Se utiliza estadística descriptiva univariada. Resultados: Se analizan 126 casos, de edad promedio 55 años, el 50.8% fue de sexo femenino; el 88.1 % ingresó con neutropenia febril; la estancia hospitalaria promedio fue de 7 días. La Escherichia coli fue el microorganismo más frecuente con el 17.5 %, seguido por Klebsiella pneumoniae en el 9.5 %, Enterobacter aerogenes y Pseudomonas aureginosa en el 4.8 %. El 70.2 % de las bacterias aisladas presentó resistencia bacteriana, el 47 % fueron bacterias betalactamasa de espectro ampliado (BLEA), el 40 % fue betalactamasa de espectro extendido (BLEE), y el 5 % productor de carbapenemasas (KPC), el 57.5 % con resistencia bacteriana tuvo una estancia hospitalaria mayor a 7 días. Conclusión: El principal microorganismo fue Escherichia coli y la resistencia mayormente la tuvieron las bacterias betalactamasa de espectro ampliado positiva; permitiendo conocer la epidemiología local del perfil microbiológico y su relación con los pacientes oncológicos con neutropenia febril.