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The chili pepper (Capsicum spp. L.) is a vegetable of economic importance that has been affected worldwide by the cucumber mosaic virus (CMV), a pathogen that causes a devastating disease in this crop. The aim of this research was the detection and characterization of CMV in chili pepper crops in Valle del Cauca, Colombia. Leaves of three chili pepper varieties (tabasco, cayenne and habanero) with viral symptoms were collected in four municipalities of Valle del Cauca. Total RNA was purified and a fragment of capsid protein (CP) from CMV was amplified by RT‑PCR. Then, it was sequenced and bioinformatically analyzed, and from these sequences, specific primers were designed. From 71 chili pepper samples collected in Palmira, Yumbo, Vijes and Yotoco, 37 were positive for CMV (52.1%). The CMV chili pepper sequence analysis showed that they had their highest identity (98.5%) with a CMV isolated from bananas in Ecuador. Specific primers designed for CMV chili pepper showed greater sensitivity for detecting this virus (64.7% vs. 52.1%). The CMV chili pepper CP analysis indicated that it could be transmitted by the species Aphis gossypii. This r the first time, the molecular characterization of CMV in three chili pepper varieties.

Virus del género Begomovirus infectan cultivos de importancia económica en todo el mundo, incluyendo ají. A la fecha, en Colombia no hay reportes de la presencia de begomovirus infectando este cultivo, por lo que el objetivo de esta investigación fue identificar la presencia de virus de este género en ají empleando estrategias moleculares. Se colectaron 197 muestras de ají en diez municipios del Valle del Cauca. Se extrajo el DNA genómico total vegetal y mediante PCR se detectó la presencia de begomovirus. Para establecer la identidad molecular del virus se amplificaron fragmentos de 1,4 kb de muestras colectadas en Palmira y Vijes. Los fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Se encontró que el 85,7 % de las muestras de ají evaluadas fueron positivas para begomovirus. Los análisis de secuencia de los fragmentos virales de 1,4 kb arrojaron una identidad de 91,8 % entre ellos y los de secuencia de nucleótidos de los virus aislados en Vijes y Palmira mostró que éstos presentan los valores de identidad más altos (87,2 % y 86,6 %) con el virus de la distorsión de la hoja de maracuyá, un begomovirus aislado de maracuyá en Colombia. Estos análisis estarían indicando que este begomovirus aislado de ají podría ser una nueva especie. De acuerdo con la literatura, este es el primer reporte de un begomovirus infectando cultivos de ají en Colombia.Virus del género Begomovirus infectan cultivos de importancia económica en todo el mundo, incluyendo ají. A la fecha, en Colombia no hay reportes de la presencia de begomovirus infectando este cultivo, por lo que el objetivo de esta investigación fue identificar la presencia de virus de este género en ají empleando estrategias moleculares. Se colectaron 197 muestras de ají en diez municipios del Valle del Cauca. Se extrajo el DNA genómico total vegetal y mediante PCR se detectó la presencia de begomovirus. Para establecer la identidad molecular del virus se amplificaron fragmentos de 1,4 kb de muestras colectadas en Palmira y Vijes. Los fragmentos fueron clonados, secuenciados y analizados. Se encontró que el 85,7 % de las muestras de ají evaluadas fueron positivas para begomovirus. Los análisis de secuencia de los fragmentos virales de 1,4 kb arrojaron una identidad de 91,8 % entre ellos y los de secuencia de nucleótidos de los virus aislados en Vijes y Palmira mostró que éstos presentan los valores de identidad más altos (87,2 % y 86,6 %) con el virus de la distorsión de la hoja de maracuyá, un begomovirus aislado de maracuyá en Colombia. Estos análisis estarían indicando que este begomovirus aislado de ají podría ser una nueva especie. De acuerdo con la literatura, este es el primer reporte de un begomovirus infectando cultivos de ají en Colombia.

Los begomovirus forman parte del grupo de virus emergentes que afectan cultivos de interés agrícola a nivel mundial. Las arvenses pueden constituirse fácilmente en hospederos alternos de estos virus y ser fuente de inóculo de los mismos. El objetivo de este trabajo fue detectar begomovirus presentes en arvenses asociadas al cultivo de tomate en Cundinamarca, Colombia. Se colectaron arvenses con y sin síntomas virales en cultivos de tomate localizados en los municipios de Pasca y Fusagasugá, Cundinamarca. Se purifico el DNA genómico total de cada arvenses y para evidenciar la presencia de begomovirus se realizó una reacción en cadena de la polimerasa con oligos específicos para detectar el componente genómico A viral. Se recolectaron 36 arvenses, de las cuales 22 especies fueron identificadas taxonómicamente. Stellaria media, Veronica persica, Galinsoga ciliata, Malva sylvestris y una especie de la familia Asteraceae resultaron positivas para begomovirus. Para las especies Stellaria media y Galinsoga ciliata, constituyen el primer reporte a nivel mundial como hospederos de begomovirus. La especie Veronica persica es identificada como reservorio de begomovirus por primera vez en América Latina. Finalmente, la especie Malva sylvestris y una especie de la familia Asteraceae se reportan por primera vez como hospederos de begomovirus para Colombia. El control efectivo de las arvenses identificadas como hospederos alternativos para begomovirus es una estrategia efectiva para disminuir el impacto de esta familia de virus en los cultivos de tomate.

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