La existencia de anomalías en anfibios se ha documentado en todo el mundo. Una anomalía morfológica se define como cualquier desviación del rango normal de variación anatómica, que puede ser causada por mutaciones, fallas en el desarrollo embrionario o trauma. En México, la información científica publicada sobre anomalías morfológicas en anfibios ha sido reciente y en la mayoría se trata de casos aislados observados en campo. Aquí presentamos el primer reporte de anoftalmia en Bolitoglossa platydactyla y un caso de exceso de piel en Rheohyla miotympanum. Así como, una lista actualizada de los casos de anomalías morfológicas en anfibios mexicanos.